Kuliah VI-Sistem Vektor Dan Inang

Embed Size (px)

Citation preview

  • 8/18/2019 Kuliah VI-Sistem Vektor Dan Inang

    1/17

    SISTEM VEKTOR – INANG

    Plasmid

    Pengantar Bio teknologi Per tanian

    Dr. Jam sari , Prog. Studi Pemuliaan Tanaman J uru san BDP-FPUA

  • 8/18/2019 Kuliah VI-Sistem Vektor Dan Inang

    2/17

  • 8/18/2019 Kuliah VI-Sistem Vektor Dan Inang

    3/17

    SISTEM VEKTOR - INANG

    VEKTOR: Media untuk dan memperbanyak dan mentransfor-masi fragmen DNA

    ?

    Dr. Jam sari , Prog. Studi Pemuliaan Tanaman J uru san BDP-FPUA

  • 8/18/2019 Kuliah VI-Sistem Vektor Dan Inang

    4/17

    SISTEM VEKTOR - INANG

    PERSYARATAN SUATU VEKTOR :

    1.REPLIKASI AUTONOM DALAM INANG

    2.BERPENANDA UNTUK SELEKSI

    3.BERPOSISI KLONING TUNGGAL

    4.BERBERAT MOLEKUL KECIL

    5.MEMILIKI BEBERAPA KOPI PADA SETIAP SEL

    6.TIDAK BERKONJUGASI

    Bioteknologi Tanaman

    Dr. Jam sari , Prog. Studi Pemuliaan Tanaman J uru san BDP-FPUA

  • 8/18/2019 Kuliah VI-Sistem Vektor Dan Inang

    5/17

    SISTEM VEKTOR - INANG

    JENIS VEKTOR:

    1. PLASMID

    2. FAG (FAG M13)3. KOSMID

    4. P1- (PAC) (Plasmide artificial chrom.)

    5. BAC (Bacterial artificial chromosome)

    6. YAC (Yeast Artificial Chromosome)

    Bioteknologi Tanaman

    Dr. Jam sari , Prog. Studi Pemuliaan Tanaman J uru san BDP-FPUA

  • 8/18/2019 Kuliah VI-Sistem Vektor Dan Inang

    6/17

    SISTEM VEKTOR - INANG

    KAPASITAS TAMPUNG BEBERAPA VEKTOR Vektor Inang Kapasitas kloning

    Plasmid Escherichia coli ~ 5000 bp

    Plasmid Saccharomyces cerevisiae ~ 5000 bpPlasmid Bacillus subtilis ~ 5000 bp

    -Phage Escherichia coli 9 – 23 kb

    Cosmid Escherichia coli 30 – 48 kb

    P1-(PAC) Escherichia coli 85 – 110 kbBAC Escherichia coli 30 – 350 kb

    YAC Saccharomyces cerevisiae 50 kb – 2 Mb

    Bioteknologi Tanaman

    Dr. Jam sari , Prog. Studi Pemuliaan Tanaman J uru san BDP-FPUA

  • 8/18/2019 Kuliah VI-Sistem Vektor Dan Inang

    7/17

    SISTEM VEKTOR - INANG

    PLASMID: DNA EKSTRAKROMOSOMAL BERBENTUKSIRKULAR TERTUTUP, BERPITA GANDA,UKURAN 1 – 200 kb.

    KROMOSOMAL DNA

    PLASMID

    Bioteknologi Tanaman

    Dr. Jam sari , Prog. Studi Pemuliaan Tanaman J uru san BDP-FPUA

  • 8/18/2019 Kuliah VI-Sistem Vektor Dan Inang

    8/17

    SISTEM VEKTOR - INANG

    Kendali replikasi plasmid

    - Kontrol ketat (stringed control)- Kontrol longgar (relaxed control) (10-200

    kopi)

    Bioteknologi Tanaman

    Dr. Jam sari , Prog. Studi Pemuliaan Tanaman J uru san BDP-FPUA

  • 8/18/2019 Kuliah VI-Sistem Vektor Dan Inang

    9/17

    SISTEM VEKTOR - INANG

    pBin1910 kb

    P O Z

    lac

    MCS = Multicloning SiteEc o RI K p n I Sma I B am HI Xb a I Sal I Hind III

    Km®

    Bioteknologi Tanaman

    Dr. Jam sari , Prog. Studi Pemuliaan Tanaman J uru san BDP-FPUA

  • 8/18/2019 Kuliah VI-Sistem Vektor Dan Inang

    10/17

    SISTEM VEKTOR - INANGKLONING DALAM PLASMID

    pBin1910 kb

    P O Zlac

    MCS = Multicloning Site

    Ec o RI K p n I Sm a I B am HI Xb a I Sa l I Hind III

    Km®

    Bam HI Bam HI Bam HI

    DNA Asing

    Bioteknologi Tanaman

    Dr. Jam sari , Prog. Studi Pemuliaan Tanaman J uru san BDP-FPUA

  • 8/18/2019 Kuliah VI-Sistem Vektor Dan Inang

    11/17

    SISTEM VEKTOR - INANG

    Km®

    DNA Ligase

    DNA Asing

    Bioteknologi Tanaman

    Dr. Jam sari , Prog. Studi Pemuliaan Tanaman J uru san BDP-FPUA

  • 8/18/2019 Kuliah VI-Sistem Vektor Dan Inang

    12/17

    SISTEM VEKTOR - INANG

    Km®

    DNA Asing

    Bioteknologi Tanaman

    Dr. Jam sari , Prog. Studi Pemuliaan Tanaman J uru san BDP-FPUA

  • 8/18/2019 Kuliah VI-Sistem Vektor Dan Inang

    13/17

    SISTEM VEKTOR - INANG

    Km®

    ABC

    DEFGH

    1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12

    PENYUSUNAN PUSTAKA DNA

    Bioteknologi Tanaman

    Dr. Jam sari , Prog. Studi Pemuliaan Tanaman J uru san BDP-FPUA

  • 8/18/2019 Kuliah VI-Sistem Vektor Dan Inang

    14/17

    SISTEM VEKTOR - INANG

    ISOLASI DNA PLASMID

    Km®

    CENTRIFUSE

    PELLET

    Tris, Buffer EDTA

    NaOH dan SDS+

    K m ®

    Km®Km®

    Km®

    Km®

    Km®

    Km®CENTRIFUSE

    Bioteknologi Tanaman

    Dr. Jam sari , Prog. Studi Pemuliaan Tanaman J uru san BDP-FPUA

  • 8/18/2019 Kuliah VI-Sistem Vektor Dan Inang

    15/17

    SISTEM VEKTOR - INANG

    Analisis DNA Plasmid dan insersi

    Bioteknologi Tanaman

    Dr. Jam sari , Prog. Studi Pemuliaan Tanaman J uru san BDP-FPUA

    Sumber: Jamsari

  • 8/18/2019 Kuliah VI-Sistem Vektor Dan Inang

    16/17

    P ENAMPILAN DNA PLASMID STLH DIISOLASI

  • 8/18/2019 Kuliah VI-Sistem Vektor Dan Inang

    17/17

    Dr. Jam sari , Prog. Studi Pemuliaan Tanaman J uru san BDP-FPUA

    Bioteknologi Tanaman

    SELESAI