27
Kalıtsal hemolitik anemilere sistematik yaklaşım ve ayırıcı tanıda yeni nesil dizi analizinin kullanımı Dr. Yeşim Aydınok 11. TPHD Kongresi, 4-7 Mayıs 2017, İzmir

Kalıtsal hemolitik anemilere±tsal... · 2017-12-04 · Kalıtsal hemolitik anemilere sistematik yaklaşım ve ayırıcı tanıda yeni nesil dizi analizinin kullanımı Dr. Yeşim

  • Upload
    others

  • View
    9

  • Download
    0

Embed Size (px)

Citation preview

Page 1: Kalıtsal hemolitik anemilere±tsal... · 2017-12-04 · Kalıtsal hemolitik anemilere sistematik yaklaşım ve ayırıcı tanıda yeni nesil dizi analizinin kullanımı Dr. Yeşim

Kalıtsal hemolitik anemilere sistematik yaklaşım ve ayırıcı tanıda

yeni nesil dizi analizinin kullanımı

Dr. Yeşim Aydınok

11. TPHD Kongresi, 4-7 Mayıs 2017, İzmir

Page 2: Kalıtsal hemolitik anemilere±tsal... · 2017-12-04 · Kalıtsal hemolitik anemilere sistematik yaklaşım ve ayırıcı tanıda yeni nesil dizi analizinin kullanımı Dr. Yeşim

Kalıtsal Hemolitik Anemiler

11. TPHD Kongresi, 4-7 Mayıs 2017, İzmir

Aile öyküsü Fizik BakıHematolojik İncelemeler

Moleküler Genetik Tanı

Anemi

Splenektomi

Kolelithiazis

Kolesistektomi

Anemi

Subikter

Splenomegali

RetikulositHaptoglobin

Laktik dehidrogenazİndirek bilirubin

Hemogram

RBC indeksleri

Periferik yayma

Page 3: Kalıtsal hemolitik anemilere±tsal... · 2017-12-04 · Kalıtsal hemolitik anemilere sistematik yaklaşım ve ayırıcı tanıda yeni nesil dizi analizinin kullanımı Dr. Yeşim

Kalıtsal Hemolitik Anemiler

11. TPHD Kongresi, 4-7 Mayıs 2017, İzmir

• Talasemiler (α,β,δβ Talasemi)

• Varyant Hemoglobinler (S,E,D,C,OArab,Lepore)

• Anstabil HemoglobinlerHemoglobinopatiler

• Embden-Meyerhof yolu (Aldolaz, PFK, PGK, GPI, HK, PK, TPI)

• Hekzos monofosfat şant ve Glutatyonmetabolizması (G6PD, GR, GS)

• Nükleotid metabolizması (ADA, AK, P5’N)

Eritrosit enzim bozuklukları

• Yapısal bozukluklar; HS, HE, HPP, SAO

• RBC membran permeabilite değişikliği; HSt (OHSt-hidrositoz, DHSt-xerositoz, CHS,FS)

Eritrosit membranbozuklukları

PFK; Fosfofruktokinaz, PGK; Fosfogliseratkinaz, GPI; Glukozofosfatizomeraz, HK; Hekzokinaz, PK; Pirüvatkinaz, TPI; Triosofosfatizomeraz, G6PD; Glukoz 6 fosfat dehidrogenaz, GR; glutatyon redüktaz, GS; glutatyon sentetaz, ADA; adenozin deaminaz, AK; Adenilat kinaz, P5’N; Primidin 5’ nükleotidaz, HS; herediter sferositoz, HE; hereditereliptositoz, HPP; herediter piropoikilositoz,HSt; herediter stomatositoz, OHSt; overhydrated stomatositoz, DHSt; dehydratedstomatositoz, CHS; kriyohidrositoz, FS; familial pseudo hiperkalemi

Page 4: Kalıtsal hemolitik anemilere±tsal... · 2017-12-04 · Kalıtsal hemolitik anemilere sistematik yaklaşım ve ayırıcı tanıda yeni nesil dizi analizinin kullanımı Dr. Yeşim

Hemoglobinopatilerin genetik temeli

• HbA : a2b2

• HbA2 : a2d2

• HbF : a2g2

• HbE2 : a2e2

• HbE1 : z2e2

Harteveld CL and Higgs DR. Orphanet J Rare Dis 2010;5:13,

Galanello and Origa. Orphanet J Rare Dis. 2010, 5:11–26

βHS=upstream regulatory element. β-LCR=β-locus control region

11. TPHD Kongresi, 4-7 Mayıs 2017, İzmir

Page 5: Kalıtsal hemolitik anemilere±tsal... · 2017-12-04 · Kalıtsal hemolitik anemilere sistematik yaklaşım ve ayırıcı tanıda yeni nesil dizi analizinin kullanımı Dr. Yeşim

Alfa ve Beta Talasemide Genotip - Fenotip

Beta Talasemi• β/β = Normal

• β/βT = Taşıyıcı

• β/βDT =Talasemi İntermedya

• βT /βT=Talasemi İntermedya

• βT /βT=Talasemi Major

Alfa Talasemi• αα/αα= Normal

• α-/αα = α+ taşıyıcı

• α-/α- veya -- /αα = α0 taşıyıcı

• -- /-α = Delesyonel HbH (β4)

• --/αTα = Non-delesyonel HbH (β4)

• -- /-- = Hb Barts (g4)

Anormal Hemoglobinler; >1500 DNA varyantı, yapısal protein varyantları oluşturur

J Traeger-Synodinos et al.EJHG, 2015

Orak hücre sendromlarıHbS/S, HbS/βT, HbS/C, HbS/D, HbS/O-Arab, HbS/HbLepore, HbS/E

Chromosome 11

11. TPHD Kongresi, 4-7 Mayıs 2017, İzmir

Page 6: Kalıtsal hemolitik anemilere±tsal... · 2017-12-04 · Kalıtsal hemolitik anemilere sistematik yaklaşım ve ayırıcı tanıda yeni nesil dizi analizinin kullanımı Dr. Yeşim

Hemoglobinopatilerde tanısal yaklaşım

J Traeger-Synodinos et al.EJHG, 2015

• Hemogram

• Periferik kan yayması ve retikulosit

• Hemoglobin fraksiyonlarının analitik ölçümü– Hemoglobin elektroforez:

• Alkali selüloz asetat

• Asidik sitrat agar

– Yüksek basınçlı sıvı kromatografisi (HPLC)

– Kapiller elektroforez (CE)

– İzoelektrik odaklanma (IF)

11. TPHD Kongresi, 4-7 Mayıs 2017, İzmir

• Anstabil hemoglobinler (OD)− Heinz body hemolitik anemiler− İsopropanol presipitasyon− Isı stabilite testi (50 0C, 1-2 h)

HPLC veya CE ile tanınamaz:• α-talasemi taşıyıcılığı

Page 7: Kalıtsal hemolitik anemilere±tsal... · 2017-12-04 · Kalıtsal hemolitik anemilere sistematik yaklaşım ve ayırıcı tanıda yeni nesil dizi analizinin kullanımı Dr. Yeşim

Hastalıkb- Talasemi

Majorb- TalasemiIntermedia

Delesyonel

HbH

Non-delesyonel

HbH

Başlangıç 3-9. aylar 2-4 yaş >4 yaş 0-3 ay

Fizik Bakı Solukluk, skleralarda subikter, splenomegali

Hemogram

Hb<7 g/dl Hb 8-10 g/dl Hb 9-12 g/dl Hb<7 g/dl

RBC, MCV ve MCH azalmış, RDW artmış, Retikulosit>%8

HPLC / CEHbF>%50,

HbA2 <%3.5

HbF %10-50 (%100)

HbA2 >% 3.5

HbH (0.8–40%)HbA2↓

EbeveynlerHer ikisi

HbA2 %3.5-7.0

Bir veya her ikisi atipik taşıyıcı

Her ikisi MCV/MCH ↓MCV/MCH ↓/ sınır MCV/MCH

HPLC normal

Page 8: Kalıtsal hemolitik anemilere±tsal... · 2017-12-04 · Kalıtsal hemolitik anemilere sistematik yaklaşım ve ayırıcı tanıda yeni nesil dizi analizinin kullanımı Dr. Yeşim

11. TPHD Kongresi, 4-7 Mayıs 2017, İzmir

Şid

det

ska

lası

Genotip SessizHbH

Klasik HbH

Non-delesyonelHbH

Transfüzyon bağımlı HbH

HbHhidrops

αα/αα--/-α

+ β thal--/-α --/αTα --/αTα

αTα/αTα--/αTα

αTα/αTα

Normal Asemptomatik Talasemi intermedia Talasemi major Hydrops

Genotip β-Talasemi Trait(2.belirleyici)

Homozigot β-Talasemi(2. belirleyici)

Klasik NTD β-Talasemi

Transfüzyon bağımlıβ-Talasemi

ΒN/ βN βN/ βT

ααα/ααΒN/ βD β++/ β+

+ α-/α-β0/ β+

+ HbH β++/ β+ β++/ β0

β+/ β0

Normal Talasemi intermedia Talasemi major

Alfa ve Beta Talasemide Fenotip-Genotip

Page 9: Kalıtsal hemolitik anemilere±tsal... · 2017-12-04 · Kalıtsal hemolitik anemilere sistematik yaklaşım ve ayırıcı tanıda yeni nesil dizi analizinin kullanımı Dr. Yeşim

Swee Lay Thein Hematology 2013:354-361

BCL11A rs1427407 (G>T)BCL11A rs10189857 (A>G)g.-158 (C>T)

HBS1L-MYB rs28384513 (A>C)HBS1L-MYB rs9399137 (T>C)

KLF1 sekans analizi

β-gen kümesi dışında sekonder belirleyiciler

2. kromozom6. kromozom

11. TPHD Kongresi, 4-7 Mayıs 2017, İzmir

Page 10: Kalıtsal hemolitik anemilere±tsal... · 2017-12-04 · Kalıtsal hemolitik anemilere sistematik yaklaşım ve ayırıcı tanıda yeni nesil dizi analizinin kullanımı Dr. Yeşim

Mutasyon tipi Moleküler Genetik Yöntem

Nokta mutasyon Reverse hybridization ve HBB, HBA, HBD DNA sekans1

Delesyon Reverse hybridization ve HBB, HBA, HBD MLPA2

1. DNA sekans; Sanger dizi analizi, 2. MLPA, multiplex ligation-dependent probe amplification

Hematolojik verilerin klinikle uyumsuz kaldığı kompleks durumları doğrulukla tanımlamada ve çoklu transfüzyon almış olguların tanısında moleküler testlere gereksinim vardır.

Hemoglobinopati Tanısında Moleküler Testler

Chromosome 11 HBD HBB

HBA

Page 11: Kalıtsal hemolitik anemilere±tsal... · 2017-12-04 · Kalıtsal hemolitik anemilere sistematik yaklaşım ve ayırıcı tanıda yeni nesil dizi analizinin kullanımı Dr. Yeşim

Kalıtsal Hemolitik Anemiler

11. TPHD Kongresi, 4-7 Mayıs 2017, İzmir

• Talasemiler (α,β,δβ Talasemi)

• Varyant Hemoglobinler (S,E,D,C,OArab,Lepore)

• Unstabil HemoglobinlerHemoglobinopatiler

• Yapısal bozukluklar; HS, HE, HPP, SAO

• RBC membran permeabilite değişikliği; HSt (OHSt-hidrositoz, DHSt-xerositoz, CHS,FS)

Eritrosit membranbozuklukları

• Embden-Meyerhof yolu (Aldolaz, PFK, PGK, GPI, HK, PK, TPI)

• Hekzos monofosfat şant ve Glutatyon metabolizması (G6PD, GR, GS)

• Nükleotid metabolizması (ADA, AK, P5’N)

Eritrosit enzim bozuklukları

PFK; Fosfofruktokinaz, PGK; Fosfogliseratkinaz, GPI; Glukozofosfatizomeraz, HK; Hekzokinaz, PK; Pirüvatkinaz, TPI; Triosofosfatizomeraz, G6PD; Glukoz 6 fosfat dehidrogenaz, GR; glutatyon redüktaz, GS; glutatyon sentetaz, ADA; adenozin deaminaz, AK; Adenilat kinaz, P5’N; Primidin 5’ nükleotidaz, HS; herediter sferositoz, HE; hereditereliptositoz, HPP; herediter piropoikilositoz,HSt; herediter stomatositoz, OHSt; overhydrated stomatositoz, DHSt; dehydratedstomatositoz, CHS; kriyohidrositoz, FS; familial pseudo hiperkalemi

Page 12: Kalıtsal hemolitik anemilere±tsal... · 2017-12-04 · Kalıtsal hemolitik anemilere sistematik yaklaşım ve ayırıcı tanıda yeni nesil dizi analizinin kullanımı Dr. Yeşim

11. TPHD Kongresi, 4-7 Mayıs 2017, İzmir

HS Gen Protein Kalıtım

HS1 ANK1 Ankyrin AD

HS2 SPTB Spectrinβ AD

HS3 SPRA1 Spectrinα AR

HS4 SLC4A1 Band3 AD

HS5 EPB4.2 Band 4.2 AR

HE Gen Protein Kalıtım

HE1 EPB41 Band 4.1 AD

HE2 SPRA1 Spectrinα AD

HE3 SPTB Spectrinβ AD

HPP SPRA1 Spectrinα AR

HSt Gen Protein Kalıtım

OHS RHAG Rh type A AD

DHS1 PIEZO1 Piezo-type ion channel AD

DHS2 KCNN4 Ca-act-K channel pr4 AD

FP ABCB6 ATP binding cassette AD

CHC SLC4A1 Band 3 AD

Adolfo I, et.al. Haematologica, 2016; 101(11); 1284-94

Page 13: Kalıtsal hemolitik anemilere±tsal... · 2017-12-04 · Kalıtsal hemolitik anemilere sistematik yaklaşım ve ayırıcı tanıda yeni nesil dizi analizinin kullanımı Dr. Yeşim

Eritrosit membran bozukluklarında tanı

11. TPHD Kongresi, 4-7 Mayıs 2017, İzmir

HS HPP HE SEAO HSt

İlk basamak incelemeler:• Aile öyküsü ve kalıtım şekli• Hb, MCV, MCH, MCHC• Periferik yayma

ODODODOR%75 OD%25 OR

MCV: N MCV: 50-60 MCV: N MCV: artmışMCV: N

Hemolitik anemi, sarılık ve splenomegali

Adolfo I, et.al. Haematologica, 2016; 101(11); 1284-94King MJ, et.al, Int J Lab Hematol. 2015;37(3):304-25.

Page 14: Kalıtsal hemolitik anemilere±tsal... · 2017-12-04 · Kalıtsal hemolitik anemilere sistematik yaklaşım ve ayırıcı tanıda yeni nesil dizi analizinin kullanımı Dr. Yeşim

11. TPHD Kongresi, 4-7 Mayıs 2017, İzmir

HS HPP HSt

Hemolitik anemi, sarılık ve splenomegali

Eritrosit membran bozukluklarında tanı

MCV N MCHC>34.5 g/dl

MCV 50-60 MCV >90DHS; MCHC >36 g/dl

OHS; MCHC 24-30 g/dl

Adolfo I, et.al. Haematologica, 2016; 101(11); 1284-94King MJ, et.al, Int J Lab Hematol. 2015;37(3):304-25.

Gallagher PG. Hematology Am Soc Hematol Educ Program. 2015

Page 15: Kalıtsal hemolitik anemilere±tsal... · 2017-12-04 · Kalıtsal hemolitik anemilere sistematik yaklaşım ve ayırıcı tanıda yeni nesil dizi analizinin kullanımı Dr. Yeşim

Eritrosit membran bozukluklarında tarama testleri

11. TPHD Kongresi, 4-7 Mayıs 2017, İzmir

% lysis

[NaCl]

Ozmotik frajilite testi(sensitivite %68)

Eosin-5’-maleimide testi(sensitivite %92-93)

Adolfo I, et.al. Haematologica, 2016; 101(11); 1284-94King MJ, et.al, Int J Lab Hematol. 2015;37(3):304-25.

Page 16: Kalıtsal hemolitik anemilere±tsal... · 2017-12-04 · Kalıtsal hemolitik anemilere sistematik yaklaşım ve ayırıcı tanıda yeni nesil dizi analizinin kullanımı Dr. Yeşim

Eritrosit membran bozukluklarında tarama testleri

11. TPHD Kongresi, 4-7 Mayıs 2017, İzmir

Tanı OF EMA

HS

HPP

OHSt

DHSt

OIHA

CDA-II

N/

N/

CDA-II; hafif hemolitik anemi, splenomegali,mikrosferositler ve OF artışı var. RetikulositHS’dan daha düşük. Splenektomiden tam yararlanmaz. Moleküler analiz: SEC23B

Polyacrylamide gel electrophoresis

Hafif olgular (%8-11) tanımlanamayabilir

King MJ, et.al, Int J Lab Hematol. 2015;37(3):304-25.Bolton-Mags PHB, et.al, British Journal of Haematology, 156, 37–49

Page 17: Kalıtsal hemolitik anemilere±tsal... · 2017-12-04 · Kalıtsal hemolitik anemilere sistematik yaklaşım ve ayırıcı tanıda yeni nesil dizi analizinin kullanımı Dr. Yeşim

Eritrosit membran bozukluklarında moleküler genetik tanı

11. TPHD Kongresi, 4-7 Mayıs 2017, İzmir

Protein (Gen) Kromozom Ekzon (n) Hastalık

Alfa spektrin (SPTA1) 1q22-23 52 HS, HE

Beta spektrin (SPTB1) 14q23-24.1 35 HS, HE

Ankyrin (ANK1) 8p11.2 43 HS

Band 3 (SLCA41) 17q21-22 20 HS, SAO,CHS

Protein 4.1 (EPB41) 1p33-34.2 21 HE

Protein 4.2 (EPB42) 15q15-21 13 HS

RhAG (RHAG) 6p12-21 10 OHSt

PIEZO1 (FAM38A) 16q24.2-16qter 51 DHSt

Glut1 (SLCA2A1) 1p31.3-35 10 CHS

ABCB6 (ABCB6) 2q35-36 19 FP

HS;herediter sferositoz, HE; herediter eliptositoz, SAO; güney asya ovalositoz, CHS; kriyohidrositoz, FP; familial pseudohiperkalemi

King MJ, et.al, Int J Lab Hematol. 2015;37(3):304-25

Page 18: Kalıtsal hemolitik anemilere±tsal... · 2017-12-04 · Kalıtsal hemolitik anemilere sistematik yaklaşım ve ayırıcı tanıda yeni nesil dizi analizinin kullanımı Dr. Yeşim

Eritrosit membran bozukluklarında moleküler genetik tanı

Aile öyküsünün açık olduğu

Fenotipik özellikleri uyumlu

Tarama testlerinin kuşku taşımadığı olgular

11. TPHD Kongresi, 4-7 Mayıs 2017, İzmir

Karmaşık fenotipik özellikleri olan

Açık bir genotip/fenotip korelasyonu kurulamayan

Genetik danışma veya yönetimi sorunlu olgular

Page 19: Kalıtsal hemolitik anemilere±tsal... · 2017-12-04 · Kalıtsal hemolitik anemilere sistematik yaklaşım ve ayırıcı tanıda yeni nesil dizi analizinin kullanımı Dr. Yeşim

Kalıtsal Hemolitik Anemiler

11. TPHD Kongresi, 4-7 Mayıs 2017, İzmir

• Talasemiler (α,β,δβ Talasemi)

• Varyant Hemoglobinler (S,E,D,C,OArab,Lepore)

• Unstabil HemoglobinlerHemoglobinopatiler

• Yapısal bozukluklar; HS, HE, HPP, SAO

• RBC membran permeabilite değişikliği; HSt (OHSt-hidrositoz, DHSt-xerositoz, CHS,FS)

Eritrosit membranbozuklukları

• Embden-Meyerhof yolu (Aldolaz, PFK, PGK, GPI, HK, PK, TPI)

• Hekzos monofosfat şantı ve Glutatyon metabolizması (G6PD, GR, GS)

• Nükleotid metabolizması (ADA, AK, P5’N)

Eritrosit enzim bozuklukları

PFK; Fosfofruktokinaz, PGK; Fosfogliseratkinaz, GPI; Glukozofosfatizomeraz, HK; Hekzokinaz, PK; Pirüvatkinaz, TPI; Triosofosfatizomeraz, G6PD; Glukoz 6 fosfat dehidrogenaz, GR; glutatyon redüktaz, GS; glutatyon sentetaz, ADA; adenozin deaminaz, AK; Adenilat kinaz, P5’N; Primidin 5’ nükleotidaz, HS; herediter sferositoz, HE; hereditereliptositoz, HPP; herediter piropoikilositoz,HSt; herediter stomatositoz, OHSt; overhydrated stomatositoz, DHSt; dehydratedstomatositoz, CHS; kriyohidrositoz, FS; familial pseudo hiperkalemi

Page 20: Kalıtsal hemolitik anemilere±tsal... · 2017-12-04 · Kalıtsal hemolitik anemilere sistematik yaklaşım ve ayırıcı tanıda yeni nesil dizi analizinin kullanımı Dr. Yeşim

Eritrosit enzimbozuklukları

11. TPHD Kongresi, 4-7 Mayıs 2017, İzmir

OD

X-bağlı

X-bağlı

• HNSHA;− Heterojen bir grup bozukluk

– Tamamen kompanse hemoliz– Transfüzyona bağımlı– Doğumda fatal anemi

− Splenomegali/sarılık/kolelithiazis− Demiri yükü (NTD olanlar dahil)

• En sık enzim bozuklukları;− G6PD (Akut hemolitik kriz)− PK (hafif-şiddetli/NSHA)− P5’N (orta şidet-Tx yok/NSHA)

• Nadir enzim bozuklukları*(nöromuskuler bzk.,mental retard.,myopati)

− Hexokinaz− Glukoz-6-fosfat izomeraz*− Fosfofruktokinaz*− Aldolaz*− Triezofosfat izomeraz*− Fosfogliserat kinaz*

• Normokrom normositer kronik hemolitik anemi• Spesifik membran bozukluğu yok• OF ve EMA test normal• HPLC varyant hemoglobin yok• DAT negatif

Page 21: Kalıtsal hemolitik anemilere±tsal... · 2017-12-04 · Kalıtsal hemolitik anemilere sistematik yaklaşım ve ayırıcı tanıda yeni nesil dizi analizinin kullanımı Dr. Yeşim

Eritrosit enzim bozukluklarında tarama testleri

• Spektrofotometrik yöntemle enzim aktivitesi (IU/Hb) ölçümü– rezidüel enzim aktivitesi ve klinik şiddet arasında korelasyon yoktur

– enzimin invitro stabilitesi

– lökosit ve trombositlerin örnekten uzaklaştırılması (isosymes)

– kan transfüzyonu

– hasta örneğindeki retikulosit sayısı (HK, PK, G6PD ve P5’N de enzim aktivitesi genç eritrositlerde yüksektir) sonucu etkileyebilir

(P5’N ve diğer nükleotid metabolizması enzimlerinin saptanmasında basit ve tekrarlanabilir bir tarama yöntemi yoktur.)

• DNA düzeyinde tanının doğrulanması

11. TPHD Kongresi, 4-7 Mayıs 2017, İzmir

Page 22: Kalıtsal hemolitik anemilere±tsal... · 2017-12-04 · Kalıtsal hemolitik anemilere sistematik yaklaşım ve ayırıcı tanıda yeni nesil dizi analizinin kullanımı Dr. Yeşim

NGS

Yeni nesil dizi analizi (NGS)

Page 23: Kalıtsal hemolitik anemilere±tsal... · 2017-12-04 · Kalıtsal hemolitik anemilere sistematik yaklaşım ve ayırıcı tanıda yeni nesil dizi analizinin kullanımı Dr. Yeşim

Ekzom Tüm Genom Hedeflenmiş

Hangi yeni nesil dizi analizi ?

Page 24: Kalıtsal hemolitik anemilere±tsal... · 2017-12-04 · Kalıtsal hemolitik anemilere sistematik yaklaşım ve ayırıcı tanıda yeni nesil dizi analizinin kullanımı Dr. Yeşim

Tüm Genom/Ekzom Dizi Analizi

%1.5

Page 25: Kalıtsal hemolitik anemilere±tsal... · 2017-12-04 · Kalıtsal hemolitik anemilere sistematik yaklaşım ve ayırıcı tanıda yeni nesil dizi analizinin kullanımı Dr. Yeşim

Genom/Ekzom Hedeflenmiş

Page 26: Kalıtsal hemolitik anemilere±tsal... · 2017-12-04 · Kalıtsal hemolitik anemilere sistematik yaklaşım ve ayırıcı tanıda yeni nesil dizi analizinin kullanımı Dr. Yeşim

• Bir çok genin bir arada çalışılması; hızlı analiz, düşük maliyet• Yeni bulunan genler kolayca panele dahil edilebilir• Elde edilen veri ile başa çıkılabilir• Hedef zenginleştirme ile ekzonların yanısıra, ‘splice sites’, intron ve

regulatör bölgeler kapsanabilir• Tanımlanan yeni varyantların patojenitesini değerlendirmek

için aile bireyleriyle birlikte çalışılması uygun olur• Yeni nesil dizi analizi ile saptanan DNA varyantları

Sanger dizi analizi ile doğrulanır

Hedeflenmiş Yeni Nesil Dizi Analizi

11. TPHD Kongresi, 4-7 Mayıs 2017, İzmir

• Kalıtsal hemolitik anemiler heterojen bir grup hastalıktır.• Klinik bulgular çoğu kez ayırt ettirici değildir.• Geleneksel testler tanı koymada yetersiz kalabilir.• Kompleks genetik yapının Sanger dizi analizi ile taranması zaman ve

kaynak kaybıdır

Page 27: Kalıtsal hemolitik anemilere±tsal... · 2017-12-04 · Kalıtsal hemolitik anemilere sistematik yaklaşım ve ayırıcı tanıda yeni nesil dizi analizinin kullanımı Dr. Yeşim

BA C D E HF G

Hi Seq ve MiSeqillumina Inc., San Diego, CA, USA

Thermo Fisher ScientificIon torrent, S.L., Waltham MA, USA