Investigarea unor markeri virali si de gazda corelati cu ... · - Dezvoltarea unui algoritm bazat pe factori virali si markeri genetici si serologici umani, utilizabil in predictia

„Investigarea unor markeri virali si de

gazda corelati cu lipsa de raspuns la

tratamentul anti-viral în hepatita

cronica cu virus C

(HepGen)

Gabriela Oprisan – INCDMI Cantacuzino

si consortiul proiectului HepGen

INFORMATII PRIVIND PROIECTUL HepGen

Proiect PCCA tip 2 nr 88/2012 (HepGen):

Titlu: Investigarea unor markeri virali si de gazdã corelati cu lipsa de

rãspuns la tratamentul anti-viral în hepatita cronicã cu virus C

Coordonator: Gabriela Oprisan- INCDMI Cantacuzino

Consortiul:

4 parteneri dintre care unul este IMM (P4 =laborator clinic de genetica):

P1 – SVB - Spitalul Clinic de Boli Infectioase si Tropicale “Dr Victor Babes”

P2 – ICF – Institutul Clinic Fundeni

P3 – IVN - Institutul de Virusologie Ştefan S. Nicolau

P4 - PG - Personal Genetics

PERIOADA de derulare

2.07.2012 – 30.06.2016

Finantare:

Total de la bugetul de stat: 3 000 000 lei

Total cofinatare (P4) = 243 375 lei

By iayork

Consortiul HepGen Coordonator: Institutul National de Cercetare-Dezvoltare pentru Microbiologie

si Imunologie „Cantacuzino”

Gabriela Oprisan; Sorin Dinu; Maria Condei; Monica Straut; Codruta Usein;

Mihaela Oprea; Monica Delia Teleman

P1: Spitalul Clinic de Boli Infectioase si Tropicale Dr. Victor Babes:

Prof. Petre Iacob Calistru; Prof. Emanoil Ceausu; Alma Kosa; Gratiela Tardei;

Simin Florescu; Cristiana Oprea; Claudia Leulescu; Angelica Nour; George

Gherlan; Gh. Voiculescu; Simona Cazacu

P2: Institutul Clinic Fundeni

Prof. Mihai Voiculescu; Elena Rusu; Monica Ecobici;

Laurentiu Micu; Diana Zilisteanu; Camelia Achim; Andreea Radasan; Mirela

Miu; Emilia Grigore; Georgia Micu; Laura Panaiteanu; Paula Dragoescu

P3: Institutul de Virusologie „Stefan S. Nicolau”

Prof. Simona Ruta; Camelia Sultana; Carmen Diaconu; Camelia Grancea;

Aura Temereanca; Petruta Mihaila

P4: SC Personal Genetics

Georgeta Cardos; Bogdanka Militescu; Petruta Gurban; Antonie Edu; Gabriela

Bucur; Cristina Ionescu; Pompilia Apostol; Vladimir Celmare; Sonia Spandole;

Eugen Radu

HEPATITA C

* Infectia produsa de HCV, virus ARN, de polaritatea + * Genul: Hepacivirus; Familie: Flaviviridae * Transmitere : parenterala, verticala, sexuala * Necultivabil (identificat prin clonare) * Poate produce infectii persistente * > 170 mil. de purtatori (3% din populatia globului) * Prevalenta in Romania: 4.56%

* Patologie: hepatita acuta, cronica, ciroza hepatica, carcinom hepatocelular

*Tratamentul clasic – PEG-interferon + ribavirin

-Tratamentele bazate pe antivirale = DAAs (inhibitori de

proteaza virala: Telaprevir, Boceprevir)

- Inhibitori de polimeraza virala (Sofobuvir) etc.

- Raspunsul viral sustinut (SVR) se obtine numai la 40–50% dintre pacientii naivi pentru tratamentul cu interferon, infectati cu HCV genotip 1, datorită selectării mutaţiilor de rezistenţă şi a unei

sensibilităţi mai scăzute la IFN/RBV a acestui genotip

- Tratamentul cu PEG-IFN si ribavirina produce efecte adverse si este costisitor

- Virusul: Genotipul HCV, cinetica virala si mutatiile in capsida virala (gena core) in pozitiile 70 si 91 sunt asociate cu raspunsul la tratamentul cu PEG-IFN /Ribavirina

- Gazda: polimorfismul in regiunea genei IL28B ca predictor major; polimorfismul genei HLA-B27 asociat cu eliminarea virala (clearance), concentratia serologica a proteinei IP-10 cu val. predictiva negativa etc.

Premizele proiectului

- Proiectul îsi propune să definească factorii de predictie a

răspunsului la terapia PEG-IFN/RBV prin analiza integrată a

factorilor virali si de gazdă

- Investigarea factorilor virali asociati cu lipsa raspunsului la tratament

(genotip, variabilitate, cinetica incarcaturii virale)

- Analiza unor factori de gazda (genetici, serologici) corelati cu

raspunsul la tratament

- Evaluarea mutatiilor de rezistenta la noile antivirale (DAAs) si a

factorilor predictivi

- Studii epidemiologice si corelarea factorilor virali cu factorii genetici si

non-genetici umani

- Transferul rezultatelor proiectului la autoritatile decidente din

domeniul politicii sanitare

Deliverabile:

- Dezvoltarea unui algoritm bazat pe factori virali si markeri genetici si

serologici umani, utilizabil in predictia raspunsului la tratamentul cu

antivirale

- Dezvoltare si transfer de tehnologie

Obiective

Niveluri la care se manifesta variabilitatea genetica:

* Sase genotipuri majore cu > 30 % divergenta

* Subtipuri (>80) cu 20-25% divergenta

•Tulpini (variante individuale) izolate in contexte

epidemiologice diferite cu 5-8% divergenta

* Cvasispecii – heterogenitate genetica HCV la

acelasi individ infectat - < 5% diferente nucleotidice

Raspunsul la terapia antivirala este mai scazut pentru

pacientii infectati cu subtipurile 1a, 1b si 4a si mai

important pentru cei infectati genotipurile 2 si 3

Variabilitatea genetica a HCV

RASPUNSUL LA TRATAMENT GHANY ET ALHEPATOLOGY, Vol. 49, No. 4, 2009

Rapid virological response (RVR) HCV - ARN negativ dupa 4 sapt. de

tratament

Early virological response (EVR) – reducere ARN HCV de >2 log10 fata de

momentul initial (EVR partial ) sau ARN HCV negativ dupa 12 sapt. de

treatment (EVR complet)

End-of-treatment response (ETR) – ARN HCV negativ la sfarsitul

tratamentului

Sustained virological response (SVR) – ARN HCV negativ la 24 sapt.

dupa incheierea treatmentului – predictor major al raspunsului pe termen

lung

Nonresponder esec terapeutic dupa 24 sapt de la incheierea trat.

- virologic breakthrough (negativare si reaparitie a ARN in timpul trat.)

- virologic relapse (recadere)

- null response (scădere < 2 log10 a viremiei în săpt. 12, fără negativare)

partial response (scădere > 2 log10 a viremiei în săpt. 12, fără negativare)

FACTORII ASOCIATI CU ESECUL

•LA TRATAMENTUL CU IFN/RBV Tarik Asselah et. al. 2010

Genomul HCV

Genomul HCV

In poziţia 70, arginina (R) este înlocuită cu glutamină (Q)

sau cu histidină (H)

In poziţia 91 leucina (L) este substituită cu metionină (M)

Akuta N, 2005; 2006

Core R 70 > Q sau H

Core L 91 > M

MODELUL EXPERIMENTAL (I)

- Studiu prospectiv cu un lot de min. 150 de pacienti

naivi, recrutati de SVB si ICF

- loturi retrospective cu pacienti care au incheiat

tratamentul (SVB si IVN)

sau pacienti care nu au raspuns la tratament (ICF)

Toti pacientii semneaza un formular de consimtamant

informat

- Criteriile de includere/ excludere au la baza protocoalele

CNAS in vigoare

- Crearea unei baze de date (anonimizata) privind

caracteristici socio-demografice, biologice,

epidemiologice, clinice, gestionata de SVB

- Analiza statistica a datelor la IC

MODELUL EXPERIMENTAL (II)

- Evaluarea raspunsului la tratament (Viral Load) la SVB

- Evaluarea fibrozei la SVB si ICF

- Analiza virala/genotipare prin PCR, qPCR si secventiere

la IC

- Selectarea unor probe virale de catre SVB pentru

secventiere nextgen la Personal Genetics (FLX

454/Roche)

- Analiza informatica si design de primeri/PCR la IC, PG

si IVN pentru analiza markerilor de rezistenta virala

- Evaluarea unor markeri genetici umani la PG si IVN

- Analiza unor markeri serologici umani la IVN

- Analiza integrată a factorilor virali si de gazdă si

dezvoltarea unui algoritm de predictie (consortiul

HepGen)

METODE - Baza de date SVB

• In perioada noiembrie 2012- iunie 2014 au fost recrutate160 de cazuri - pacienti cu hepatita cronica C, fara coinfectii cu HBV, HIV

•Media de varsta este de 49 de ani (22 - 68 ani), 46.9% barbati.

•Majoritatera pacientilor din lot provin din mediul urban

(73,8%), si au pregatire scolara medie sau superioara (80%).

•10 dintre pacienti (6,3%) se afla la al doilea tratament antiviral

•Cei mai multi pacienti au declarat unul sau mai multi factori de

risc pentru contactarea infectiei virale HCV:

- 79.4% tratamente stomatologice

- 30.0% transfuzii de sange

- 12.5% agregare familiala

- 5.6% risc profesional


• La momentul actual, dintre cei 160 de pacienti recrutati, un numar de 60 au terminat tratamentul de 48 de saptamani

•Dintre pacientii chestionati pentru reactii adverse (n=84),52

(61.9%) au prezentat cel putin o reactia adversa

•Cele mai frecvente reactii adverse evidentiate in timpul

tratamentului sunt, in ordinea aparitiei:

- modificarea apetitului alimentar, cu scadere ponderala

- reactii adverse hematologice (anemie, neutropenie,

trombopenie)

- alterarea starii generale +/ - sindrom anxios depresiv


Analiza raspunsului virusologic pt. pacientii SVB

•RVR = 12%

•RVR partial =19%

•EVR = 39.8%

•EVR partial= 80.8%

•SVR = 36.4%

METODE - Studiu prospectiv – analiza statistica realizata pe un

lot de 87 de pacienti cu hepatita cronica, infectati cu

HCV genotip 1b, fara coinfectii cu HBV sau HIV, au

inceput trat. cu IFN/RBV

- Evaluare VL (viral load) pt. RVR (4 sapt.) si EVR

(12 sapt.) comparativ cu VL la initierea tratament

Analiza virus:

- PCR si secventiere in gena core

- PCR si secventire in gena NS3

- PCR si secventiere genom HCV prin tehnica

Next-generation (FLX 454/Roche)

- dezvoltarea unor sisteme Real-Time PCR de

tip ARMS pentru detectia mutatiilor de rezistenta

virala Core 70 si 91

METODE

Analiza genetica umana:

- polimorfism in gena IL28B (SNP rs12979860)

- polimorfisme in gena ITPA (anemie)

- genotipare HLA-B27

Analiza serologica:

- nivelului plasmatic al proteinei IP10

- nivelului plasmatic al proteinei sCD26

Analiza statistica a fost realizata cu programul SPSS

versiunea 16.0 (dr. Monica Delia Teleman, IC)

Genotiparea HCV prin secventiere in gena core N = 140 (la IC)

3a-2,8% *0.5%

4a-2,8% *1.5%

1a – 9,8% *3%

1b - 84,6% *92,6%

*Sultana C, Oprisan G, Szmal C, Vagu C, Temereanca A, Dinu S, Teleman

MD, Ruta S. Molecular epidemiology of hepatitis C virus strains from

Romania. J Gastrointestin Liver Dis. 2011 Sep;20(3):261-6.

REZULTATE ANALIZA VIRUS

Amino Acid Substitutions in the Hepatitis C Virus Core

Region are the Important Predictor of Hepatocarcinogenesis Norio Akuta et al. HEPATOLOGY, Vol. 46, No. 5, 2007

- Mutatii in core: 70 R > Q/H si 91 L > M ca predictori pentru

rezistenta la tratament (PEG-IFN + ribavirin) si carcinogeneza

hepatica

- Proteina core are potential oncogenic la soarecii transgenici

- Importanta in clinica: la pacientii din Japonia, de genotip 1b si cu

mutatii de rezistenta in core, tratati in mod repetat numai cu IFN, s-a

constatat reducerea riscului de carcinogeneza hepatica si cresterea

ratei de supravietuire

- Carcinogeneza hepatica este influentata de interactia dinamica

dintre Virus – Gazda si Tratament

Genotiparea HCV prin secventiere in gena core

Alinierea secventelor aac pt vizualizarea mutatiilor Core 70 si Core 91

Antiviral therapy – Standard of Care

- Pegylated interferon alfa (PegIFN) and ribavirin (RBV) for

24-48 weeks,depending on the viral genotype

- 2011: the advent of direct-acting-antivirals (DAAs)

- the standard of care for many patients with HCV

genotype 1 infection became a combination of an oral NS3

protease inhibitor boceprevir or telaprevir along with

pegylated IFN (PegIFN) and ribavirin (RBV).

In Romania: PegIFN + RBV

DAAs in teste clinice

Yee et al - The American Journal of GASTROENTEROLOGY 2012

CLINICALLY RELEVANT HCV DRUG RESISTANCE MUTATIONS: DAAs

NS3 Protease (180 aa) Nina Mani, 2012

Mutatii de

rezistenta

la DAAs:

V36, T54,

T55, R155,

A156,

V170 etc.

Aliniament al secventelor proteinei NS3 (181 aac) –

prin programul BioEdit

Mutatia de rezistenta la telaprevir I132 V preexista la

pacientii naivi pentru tramentul cu antiproteaza

REZULTATE ANALIZA VIRUS

PCR si secventiere in gena NS3

I132 V

PCR si secventiere genom HCV prin tehnica

Next-generation - Metode

• Secvențierea de mare randament (next-generation sequencing) a genomului HCV 1b (dr. Eugen Radu si drd. Sonia Spandole, PG)

• 11 pacienți recrutati la SVB (4 din lot retrospectiv, cu status de raspuns cunoscut – 2 responderi si 2 non-responderi)

• Inclusa o tulpina de referinta HCV 1b, clonata intr-un plasmid - secvență de control pt NGS (pFK-Con1 obtinut prin amabilitatea prof. Ralf Bartenschlager, Univ. Heidelberg)

• Platforma de pirosecvențiere de mare randament Genome Sequencer 454 FLX/ Roche de la Personal Genetics

• Număr foarte mare de fragmente de ADN relativ scurte (30 - 400 baze) - într-un singur experiment pot fi citite 0,4 - 30 miliarde de baze (cvasispecii si variante virale rare)


Next-generation- Metode

• Reverstranscriere ARN viral cu primeri specifici

• Nested-PCR: 3 ampliconi de aproximativ 2500 pb

(57 – 7698) (drd. Sorin Dinu, IC)

Yao E et al, Virol J 2:88, 2005



• Fragmentarea ampliconilor prin nebulizare (shot-

gun)

• Ligarea de adaptori ce includ secvențe unice,

necesare multiplexării (MID)

• Amplificare în emulsie si pirosecvențiere



PROCESAREA SI ANALIZA DATELOR

• Achiziția de imagine, analiza primară, identificarea

bazelor individuale și a calității acestora – software

454 Roche

• Filtrarea secvențelor, asamblarea de contigi pentru

fiecare pacient – Vicuna

• Finalizarea, adnotarea secvențelor consens – V-FAT

• Corecția erorilor de pirosecvențiere – RC454

• Analiza variației intrahost – V-Phaser 2

• Toate programele de la The Broad Institute Viral

Genomics Group


Next-generation - Rezultate

- Peste 1 milion de fragmente citite totalizand 400 Mbaze

- Fragmente de aprox. 450 baze

• Acoperirea (redundanța) citirilor pentru cazuri și control între

1410 și 5040 x

• Secventa control: tulpina HCV 1b con-1, clonată în

plasmidul pFK, identică cu cea publicata

Acoperirea pentru HCV 1b con-1



Frecvența mutațiilor non-sinonime pentru cazurile R04 și R06

(SVR)



Frecvența mutațiilor non-sinonime pentru cazurile R14 și R16

(esec terapeutic)



Frecvența mutațiilor non-sinonime pentru cazurile SVB003 și SVB011 (SVR)

60 M

b

Chromosome 19

A Polymorphism on Chromosome 19 Predicts SVR

SNP rs12979860

SNP rs8099917

IL28B

3 k

b

Ge D, et al. Nature. 2009;461:399-401.

Importance of IL28B

Polymorphisms (SNP rs12979860)

* C/C genotype is associated with a higher SVR compared

with T/C or T/T

• Treatment-naïve, genotype 1-infected patients with IL28B

genotype CT or TT have a higher SVR when treated

with DAA-PegIFN and RBV as compared with PegIFN

and RBV treatment alone

Ge D, et al. Nature. 2009;461:399-401.

Markerul genetic uman IL28B

SNP rs12979860: CC – asociat cu SVR

TT and CT – asociate cu esecul terapeutic

rs12979860

Testat prin reactia de discriminare alelica - Custom TaqMan Single

Nucleotide Polymorhism Genotyping Assays (Applied Biosystem) la IVN, PG

Rezultate IL28B : 17.8% genotip CC

64.4% genotip CT

17.8% genotip TT

Studiul markerilor genetici umani ITPA si HLA-B27

Personal Genetics

Asocierea dintre prezenta unei alele HLA-B27 si clearance-ul spontan al HCV (metoda PCR + hibridizarea inversa - kit IVD GenoQuick HLA-B27, HAIN)

Studiul markerilor 94C>A (rs1127354) și IVS2 + 21 A>C (rs7270101) din gena ITPA pentru evaluarea riscului de anemie medicamentoasa severa sub trat. cu IFN/RBV prin metoda PCR-RFLP (cu enzima de restrictie XmnI)

Reducerea activitatii enzimei ITPA poate reduce severitatea anemiei in grade diferite, in functie de polimorfismele existente in gena ITPA

Studiul markerilor genetici umani ITPA si HLA-B27

Personal Genetics

•Rezultate HLA-B27

•Alela HLA-B27 prezenta la 6% dintre pacienti (N= 100), frecventa

similara de pina la 8%, raportata in literatura pt. populatia de origine

caucaziana (Neumann-Haefelin 2007)

Studiul markerilor ITPA Au fost identificate genotipuri homozigote de tip sălbatic (wt), precum

și genotipuri heterozigote pentru polimorfismele testate

Genotipuri homozigote mutante au fost obținute numai pentru markerul

ITPA IVS2 + 21 A>C

Datele obtinute sunt comparabile cu datele raportate în literatura

(polimorfismul ITPA 94C>A (rs1127354): alela minora A=0,081;

polimorfismul IVS2 + 21 A>C (rs7270101), alela C=0,074; SNP

Database, National Center for Biotechnology) dar inca nu au putut fi

corelate cu anemia indusa de IFN/RBV

Studiul markerilor serologici umani IP10 si sCD26

Institutul de Virusologie „Stefan S. Nicolau”

•Analiza serologica: •Nivelul plasmatic al IP-10 (Interferon-gamma inducible

protein 10) – testat cu Quantikine Human CXCL10/IP-10,

R&DSystems

- IP10 - chemokina cu activitate chemotactica pentru

limfocite, celule NK si monocite

•corelata cu inflamatia hepatica

•Nivelul plasmatic al sCD26 (Human sCD26 ELISA, ALPCO)

•Proteina CD26 este o glicoproteina de membrana dipeptidil-

peptidaza (DPPIV) care cliveaza peptide - IP-10

•Forma solubila sCD26 descris ca un marker serologic fiabil si

ieftin in evaluarea severitatii bolii hepatice la pacientii HCV

(marker de inflamatie hepatica)

Studiul markerilor serologici umani IP10 si sCD26

Institutul de Virusologie „Stefan S. Nicolau”

Rezultate

- Concentratiile scazute baseline ale IP10 si sCD26 sunt

direct corelate cu valori reduse baseline ale ARN HCV si cu

grad mic de fibroza hepatica (p=0.04 si p=0.05)

- Valori scazute baseline ale IP10 (330.2 vs. 449.6 pg/mL; p=

0.05) si sCD26 (786.1 vs. 892.2 ng/mL; p= 0.03) anticipeaza

RVR si a EVR complet

IP10 se coreleaza negativ cu

diferenta de viremie HCV

dintre T0 si T12 (p=0.0017)

ANALIZA STATISTICA A DATELOR Dr. Monica Delia Teleman (UMF, IC), HepGen

REZULTATE (N = 87)

RVR, EVR

• 13 (14.9%) RVR total

• 39 (44.8%) – EVR total

• 69 (79.3%) – EVR Total + Partial

Interferon and Ribavirin Treatment Outcome for HCV, at 4 and 12 weeks

14.9

44.8

79.3

0

10

20

30

40

50

60

70

80

90

RVR Total EVR Total EVR Total+Partial

Treatment Outcome

% o

f T

ota

l cases

RVR Total

EVR Total

EVR Total+Partial

ANALIZA STATISTICA A DATELOR Dr. Monica Delia Teleman (UMF, IC), HepGen

REZULTATE (N = 87)

Media de varsta de 50 de ani

57 % gen feminin, mai in varsta decat cazurile de gen masculin (p in T test pentru grupe independente = 0.004)

HCV cases by Gender

57%

42.5Female

Male

Caracteristici socio-demografice vs. gen

Variable/ Gender Male

(No.)

Female

(No.)

P-value*

Age (yrs.) < 40 14 5 0.002

≥ 40 23 45

Occupation Yes 24 32 1

No 13 18

Education

(classes)

< 12 5 11 0.4

≥ 12 32 39

Residence Rural 8 19 0.2

Urban 21 25

BMI < 25 17 25 0.8

≥ 25 20 25

78.2 % varsta

= sau > 40 de

ani

* Pearson Chi2 or Fischer’s Exact Test

RVR/EVR vs. gen

Pacientii de gen Masculin au obtinut RVR in procent mai

mare (24.3.%) comparativ cu cazurile de gen Feminin

(8%) (p = 0.06)


Gender RVR EVR

No % OR

*P-

value

No % OR *P-

value

Male 9 24.3 3.7 0.06 18 54.5 1.6 0.3

Female 4 8.0 21 42.9

RVR total vs. caract. virus/gazda


Host caracteristics

(baseline) (Media

aritmetica +/- sd)

RVR No RVR *P-

Value

Age (yrs.) 39.8 (13.1) 51.9 (9.9) 0.007

BMI

25.2 (3.8) 25.9 (4.3) 0.6

ALT (IU/ml) 101.6 (54.0) 87.5 (53.8) 0.4

Glucose (mg/dl)

91.5 (14.5) 103.1 (38.3) 0.3

sCD26 793 (270.6) 701.9

(246.5)

0.3

IP10 355.6

(161.6)

448.4

(288.1)

0.1

HCV RNA log10 (IU/ml)

4.6 (1.3) 6.1 (0.6) <0.001

EVR total vs. caract. virus/gazda

Host caracteristics

(baseline) (Mean +/- sd)

EVR No EVR 95%CI *P-

Value

Age (yrs.) 46.4 (11.9) 54.3 (8.9) 3.3,12.7 0.001

BMI

25.9 (3.6) 25.7 (4.7) -2.04,1.6 0.8

ALT (IU/ml) 92.5 (62.5) 83.5 (45.0) -33.2,15.3 0.5

Glucose (mg/dl)

92.6 (14.5) 109.5 (46.8) 0.5,33.3 0.04

sCD26 655.0 (236.3) 754.7 (260.8) -10.1,209.5 0.07

IP10 318.7 (177.2) 529.9 (320.6) 95.7,326.7 <0.001

HCV RNA log10 (IU/ml)

4.6 (1.3) 6.1 (0.6) 1.04,2.04 0.002

EVR au fost mai tineri si au prezentat valori semnificativ mai mici pentru

IP10, Glicemie si ARN HCV la initierea trat. (T0)

Genotipurile IL28 B

IL28B

Characteristics(baseline)

Mean (+/- sd)

CC CT+TT *P-value

Age (yrs.) 47.0 (12.8) 51.0 (11.2) 0.18

ALT (IU/ml) 115.0 (77.6) 84.7 (43.4) 0.04

Hb (dl/mg) 14.9 (1.2) 14.1 (1.1) 0.01

IP10 324.1 (210.5) 467.9 (279.2) 0.03

CD26 620.1 (191.6) 730.6 (257.0) 0.06

HCV RNA Log10 (IU/ml) 5.8 (1.2) 6.0 (0.7) 0.3

* T test for Means, Independent Samples.

Pacientii cu genotip CC versus genotipurile CT/TT

- mai tineri, valori ALT si Hb (T0) mai mari

- valori semnificativ mai mici pentru IP10 si CD26

RVR, EVR vs. IL28B

* T test for Means, Independent Samples.

Pacientii cu genotip IL28 B tip CC au o sansa mai mare de a

obtine RVR (p= 0.01) si/sau EVR (p<0.001), comparativ cu

pacientii care prezinta celelalte genotipuri.

37.5

93.3

12.5

38.5

0

33.3

0

10

20

30

40

50

60

70

% of Total HCV cases

CC CT TT

Il28B genotype

RVR

EVR

RVR, EVR vs. gradul de fibroza

Exista diferente pt. obtinerea RVR si/sau EVR, bazate pe

scorurile de fibroza, dar diferentele nu sunt semnificativ

statistice (RVR, p value = 0.3; EVR, p-value = 0.05)

20

63

8

38

0

10

20

30

40

50

60

70

% of Total HCV cases

F0+F1+F2 F3+F4

Fibrosis Score

RVR

EVR

RVR si EVR vs. mutatiile 70, 91 in gena virala core

• Mutatia core 70 prefigureaza o sansa mai mica pt. obtinerea RVR (Fisher’s Exact Test: p-value 0.016)

• Nu sunt diferente semnificative pt. obtinerea RVR pt. pacienti cu mutatia virala core 91 (OR = 2.5, Pearson Chi2 Test: p-value = 0.1)

• Capacitatea de a atinge EVR nu pare a fi afectata de mutatiile core 70 sau 91

CONCLUZII

• Prin analiza univariata a lotului de pacienti HepGen

caracteristicile urmatoare:

- varsta, genul

- polimorfismul in gena IL28B

- valorile baseline: Hb (mg/dl); IP10; ARN HCV

(IU/ml)

• mutatiile in gena virala core 70 si 91

• par sa fie predictori pentru evolutia buna la 4

saptamani (RVR) sau 12 saptamani (EVR) de la

debutul tratamentului cu IFN/RBV

COMUNICARI/ PUBLICATII


9-11 octombrie 2013, la Hotelul Pullman Bucuresti,

ICF a organizat Al XXIII –lea Congres National de

Hepatologie, Al III-lea Congres deHepatologie

Romano-francez si al IV Curs Balcanic de

Hepatologie

Prof. Dr Mihai Voiculescu “Improving

patient outcome using predictors of

response and management of

adverse events”

Gabriela Oprisan “ Viral mutations

correlated with treatment response in

chronic hepatitis C”

COMUNICARI/ PUBLICATII Poster la congresul ECCMID – Barcelona, 2014


Documents

Investigarea unor markeri virali si de gazda corelati cu ... · - Dezvoltarea unui algoritm bazat pe factori virali si markeri genetici si serologici umani, utilizabil in predictia