I Parcijala

7/26/2019 I Parcijala

1/46

Sta je predstavljeno na slici.Objasni strukturne karakteristike predstavljene molekule:

Mioglobin je kompaktna mol.dimenzija 4,5x3,5x,5nm.!5" lanca je uobliku # al$a %elixni%

segmenata&oznaceni slovima od ' do ().*zmedju %eliksa nalazi se 5 ne%eliksni%

segmenatakoji povezuju %elikse &oznaceni su kao '+,-,/...itd) i jos ne%eliksna regiona

na 0 i terminusu& ak na 0 i 5 ak na .).1 unutrasnjosti se nalaze nepolarni ostaci i polarna ostatka %istidina.(em je smjesten u dzepu koji najvecim dijelom grade i /

%eliksi.Molekula mioglobina se sastoji iz 2 polipeptidnog lanca.Strukturni motiv u koji je

svijen polipeptidni lanac mioglobina nazvan je globinsko nabiranje i karakter.je za molekule

prenosioce kisika,omogujuci %emu da reverzibilno vezuje kisik.(em se sastoji iz

protopor$irina na koji je vezan jos zeljeza u /ero oksidacijskom stanju&).or$irinski

prsten sastoji se od 4 pirolova prstena koji su povezani metilskim mostovima,na pirolove

prstenove kao bocni lanci vezani su ostatska propionske kiseline, vinilne i 4 metilne

grupe.Ovo /e moze graditi 6 koordinativne veze....&strana 6 praktikum)

ta je predstavljeno na slici ?

Na slici je prikazan MHC 1 protein.MHC proteini klase 1 imajunevarijabilni B lanac (B2 mikrolobulini! i varijabilni "#lanac .$ba

su smjestena e%tracelularno.&vaki covjek stvara ' razliciti "lanaca za klasu 1 MHC proteina.)naci da B lanac ne ucestvuje u*ormiranju ipervarijabilno reiona odnosno mjesta zavezivanje antiena. MHC 1 proteini nalaze se na povrsini celijakicmenjaka .+ada stvori peptid dospije u cistol , oni sekombiniraju sa proteinom MHC1 te kao takvi vezu se sa vanjskestrane celijske membrane kao sinali za kaskadni proces .


2/46

Napisi rakciju alanin aminotrans*eraze .+oji koenzim ucestvujeu reakciji?$bjasni njeovu ulou ?

Meanizam prenosa amino skupine pomocu alanin

aminotrans*eraze odvija se uz pomoc koenzima piridoksal*os*ata .

-ri reakciji transaminacije, a.k. i piridoksal *os*at , koji je vezanza enzim , stvaraju bazu .Mezo.......... , pomakomdvostruke veze i idrolizom dolazi do izdvajanja 2 okso kiseline ,a piridoksal *os*at ostaje vezan za enzim.-iridoksalni *os*atdalje reauje sa "#oksolutaratom dajuci bazu. Nakonpomaka dvostruke veze idrolizom se oslobadja lutamat .

ta je predstavljeno na dijaramu ? $bjasni promjenu kinetickiparametara na datoj slici .

/ijaram predstavlja enzimsku kinetiku u prisustvu i bez

kompetitivno inibitora . Moze se konstatovati da ezivanjekompetitivno inibitora na aktivno mjesto u enzimu umjestosupstrata dovodi do promjene Micaellsove konstante kojapredstavlja odnos supstrata i enzima ( ako je k0 k2! jacinenjiovo vezivanja kao i njiovo aniteta , sto je kM manje tose supstrat labavije veze i ima manje aniteta .3 kompetitivnojinibiciji kM se povecava , 4ma% ostaje nepromjenjeno.)nacajka ovo vida inibicije jeste sto se moze sprijeciti

koncentracijama supstrata.154 6 +m 54ma% 7 15Cs 8 15 4ma%

7 1 5+m odsjecak na apcisu


3/46

$bjasni sta je prikazano na slici i obiljezi pojmove napredvidjenim mjestima na slici.

Na slici je prikazan prostorni raspored kljucni aminokiselinskiostataka oko ema miolobina.$2 idroenskom vezompovezan oksitalni istidin .9unkcija prostetske upe modelirana

je njenom okolinom.4ezivanja $2 za em ovisi i odmolekularno kretanja , osnosno disanja proteinske strukture.Model miolobinsko vezivno mjesta za kisik pokazuje em,proksimalni istidin (9:! i distalni istidin (;


4/46

intermedijarno ....................!. l*a keratinski eliks je (desno!orijentisan./va lanca eliksa su umotana jedan oko druo icine (superuzvojnicu! koji je (lijevo! orjentisan ./va lanca(supereliksa ! su paralelno povezana preko (idro*obni!

ostataka.

1@.$bjasni strukturne karakteristike molekule prikazane na slicii navedi njene uloe u oranizmu.

AM imunolobulini koji se prvi sintetise u imunomodovoru.edini je pentamer .Ama 1D mjesta za vezivanjeantiena .-oprecno jepovezan disuldnim vezama , a sadrzi iveze koje povezuju teske lance. A lanac ima Mr #2DDDD.Nalazi sesamo u krvnim sudovima.edini A koje novorodjence normalnosintetizira.4eoma je ekasan aktivator komplemenata.-ovisen

je kod bilijarne ciroze ,virusno epatitisa,in*ekcije parazitima.

1. )aokruEi taFne tvrdnjeG

Hidroksilna grupa tirozina o!e "orirati #idrogenske veze

irozin i *enil#alanin su polarniji od tripto*ana

&vi boFni lanci aromatski aminokiselina su nepolarni

&vi boFni lanci aromatski aminokiselina su polarni

NiIta od navedeno nije taFno

2. minokiselina ornitin jeJ

-roteinoena

Neutralna

+isela

Bazna

Antermedijer metabolizma istidina

0. +olika je pribliEna Mr proteina koji sadrEi 1K' aminokiselinski ostataka?


5/46

1:.'::

2D.1K:

$%&'%' 1K'711D61'.D'D

1:.D'D

NiIta od navedeno

K. +riva disocijacije oksiena normalno adultno emolobinanajekasnije se pomijera nadesnoJ

!MijeIanjem adultno emolobina sa *etusnim emolobinom

B()ove*anje kon+entra+ije 2, .i"os"ogli+erata

C!+ooperativnim vezanjem oksiena

/!-oviIenjem pH

;!&niEenjem C$2

=. +ako se inibira aktivnost tripsina?

A()oo*u de"os"orila+ije

B!-omoLu druo cijepanja

C!&ve od navedeno

/!NiIta od navedeno

'. ta od nabrojano predstavlja svojstvo mjesta vezivanja antiena?

!&adrEe aminokiselinske ostatke koji se kovalentno veEu za antien

B(Foriraju nogo.rojne #idrogenske veze, sla.eelektrostatske, /an 0er 1alsove i #idro"o.ne interak+ije sapovrino antigena

C!&mjeItena su izmeu dvije povrIi unutar 4 domena0(3ine i# petlje "orirane od C04 regija /L i /H doena

5(6on"ora+ijski se ijenjaju nakon vezanja antigena ili#aptena


6/46

A(6inetiku alosteri7ki# enzia

B(/ezanje oksigena na #eoglo.in

C!Midiaelis#menten kinetiku

/!kompetetivnu inibiciju

;!4ezanje oksiena za miolobin

:. +oja je od sljedeLi tvrdnji o strukturi AO taFna?

a! Na ona mjesta za vezanje antiena na AO molekuli mou se vezatistrukturno razliFiti epitopi

.( 8e9ulan7ane i unutarlan7ane disul:dne veze sta.ilizirajustrukturu Ig;

c! " i H lanci AO sadrEe domene sa sliFnim strukturama

d! -odjedinice AO vezu se za komponente komplementarno puta da bizapocele put incirane celije

e! 4ezanje AO za speciFne antiene odredjuju samo invarijabilne reijeal*a lanca

@. +oji od sljedeLi odovora korektno zavrIava reFenicu?

Hemolobin se razlikuje od miolobina po tome Ito

a( 8ioglo.in je onoer a #eoglo.in je ultier

b! Hemolobin veEe $2 mnoo FvrILe od miolobina pri bilo kojojkoncentraciji $2

c! 4ezanje C$2 za emolobin mnoo je ekasnije neo za miolobind! 4ezanje $2 za emolobin ne zavisi od koncentracije C$2,H8 i B-O


7/46

dok vezanje $2 za miolobin zavisi

e! Niti jedan odovor nije taFan

1D. Nedostaci likolize u eritrocitu mijenjaju prijenos oksienaJ

a! +od nedostatka eksokinaze malen je anitet emolobina premaoksienu

.( 6od nedostatka #eksokinaze veoa je visok a:nitet#eoglo.ina prea O2

+( 6od nedostatka piruvat kinaze alen je a:nitet #eoglo.inaprea O2

d! +od nedostatka piruvat kinaze veoma je visok anitet emolobinaprema oksienu

e! &ve nabrojano je netaFno

11. $bjasni proces predstavljen na slici.

-rezentacija peptida nastali od citosolni proteina

MHC proteini A klase nalaze se na povrIini otovo svake Lelije u vertebrata.

o je najpolimor*niji od svi proteina. Antracelularni patoeni su zaItiLeniod antitijela Lelijskom membranom domaLina. /iestija vlastiti i tui


8/46

proteina odvija se u citosolu u proteosomu. 3 endoplazmatskomretikulumu peptidi se kombinuju sa MHC A i ovi se kompleksi veEu zaendoplazmatsku membranu. &trani peptidi vezani za MHC protein klase Asinaliziraju da je Lelija incirana i markiraju je za destrukciju koju Le

izvrIiti citotoksiFne Lelije.&trani peptidi vezani za MHC proteine klase Asinaliziraju da je Lelija incirana i markiraju je za destrukciju citotoksiFni Lelija. +ompleksJ strani peptid MHC A#receptor LelijeJkoreceptor(C/:!zapoFinju kaskadu u kojoj se lizira incirana Lelija. &tvaraju se velikepore(protein per*orin! u plazmatskoj membrani Lelije domaLina.CitotoksiFne Lelije zapoFinju i proces koji se zove apoptoza iliproramirana smrt Lelije.

12. -oveEi aminokiseline u lijevoj koloni sa pripadajuLim proteinima u

desnoj koloniJa. Hidroksilizin


9/46

+m i 4ma% su vaEne karakteristike enzima. )a veLinu enzima +m leEi upodruFju izmeu 1D#1 i 1D#< mol5dm0. +m vrijednost ovisi o vrsti supstratai o uslovima sredine kao Ito suJ pH, temperatura i jonska jakost. +m jekoncentracija supstrata pri kojoj je polovina aktivni mjesta popunjena. +m

je jednaka konstanti disocijacije kompleksa ;& ako je +2+1. 3 ovimuslovima +m je mjera jaFine kompleksa ;&. 4isoka +m znaFi slabovezivanje i vice versa.

$&8e#aniza djelovanja N0H koenzia=

Nikotin amid koenzimiJN/8 i N/-#.;nzimi deidroenaze koji katalizujudeidroeniziranje primarne ili sekundarne rupe N/8 i N/-8 suaktivni oblici vitamina B0.

Meanizam djelovanjaJ-renos vodika u obliku idronijum jona H8 sasupstratom na atom piridinsko prstena ,pri cemu N atom ubi pozitivannaboj.

&pecicnost reakcije prijenosa HJsupstrat prilazi molekuli N/8 sa jednestrane i predaje H#,H# koji se sa N/H predaje druom supstratu potice sadrue strane piridinsko prstena molekule N/H.

9izioloski znacajJN/85N/H redoks prsten koji prenosi elektrone sasupstrata na enzime respiratorno lanca(N/5N/HQ1!. N/-8 i N/-H

redo% sistem sluzi kao donor H atoma u reduktivnimbiosintezama(N/-5N/-H1!. +oenzim se vezuje labavo i ireverzibilnoputem nekovalentni veza.+oenzim se obnavlja u toku katalize najcescesudjelujuci u katalizi dviju razliciti bioemijski reakcija.-rimjerliceraldeid 0 *os*at deidroenaza. -osjeduje jako vezujuce mjesto zadeidrirani oblik koenzima N/.Nakon deidratacije supstrata reduciraniN/H napusta enzim.Reoksidacija N/H se vrsi uz pomoc druo elektronakceptor sistema.

dliceraldeid#0 *os*at8N/88H88-26Q1,0 bi*os*olicerat8N/Hpiruvat8N/H8H86Qlaktat 8 N/8

1=. ta je predstavljeno na slici? $bjasni strukturne karakteristikepredstavljene molekuleG


10/46

Miolobin je kompaktna mol.dimenzija K,=%0,=%2,=nm.


11/46

c. Hidrolna, naelektrisana i baziFna

d& Hidro"o.na

e. Hidrolna, naelektrisana i kisela

1:. 9unkcija mnoi enzima, membranski transportera i drui proteinamoEe se brzo aktivirati i deaktivirati *os*orilacijom aminokiselinskiostataka pomoLu enzimaJ

a! Ciklaza

b! +inaza

+( Fos"ataza

d! -roteaza

e! )inoenaza

1@. +ompetitivni inibitorJ

a( )ove*ana k .ez projene /a>

b! &niEena km i sniEena 4ma%

c! &niEava 4ma%

d! -oveLa 4ma%

e! -oveLava km i poveLava 4ma%

2D. +oji se od nabrojani enzima reulira primarnom alosteriFkominterakcijom?

a! Himotripsin

b! -iruvat deidroenaza

c! Olikoen *os*orilaza

d! Olikoen sintaza

e( Aspartat transkar.oksilaza

21. 3loa distalno istidina u miolobinu jeJ

a& )oo* u odr!anju 8. u "ero stanju

b. &prjeFavanje Fvrsto vezanja C$2

c. 4ezanje za petu koordinativnu poziciju 9e

d& Sprje7avanje 7vrstog vezanja CO

e& /ezanje O2

22. +oja je od sljedeLi tvrdnji taFna?


12/46

a& 6riva aktiva+ije do.ijeno za ioglo.in ia o.lik #iper.ole aza #eoglo.in sigoide

.& A:nitet #eoglo.ina za O2 reguliu organski "os"ati, doka:nitet ioglo.ina za O2 ne reguliu

c. Hemolobin ima veLi anitet za $2 od miolobinad& A:nitet ioglo.ina i #eoglo.ina za O2 ne ovisi o pH

e& Heoglo.in ia anji a:nitet za O2 od ioglo.ina

20. +oja je od sljedeLi tvrdnji taFna? Hemolobin & *ormira broznereceptoreJ

a( Zato to valin na pozi+iji %? lan+a stvara ljepljive #idro"o.nepovrine

b! +oji su reverzibilni prilikom oksienacije+( 6oji ijenjaju o.lik eritro+ita

d! &amo u oteolin *ormi

e! &amo kod omoziota

2K. ta od nabrojano predstavlja svojstvo mjesta vezivanja antiena?

a. &adrEe aminokiselinske ostatke koji se kovalentno veEu za antien

.& Foriraju nogo.rojne #idrogenske veze, sla.e

elektrostatske, /an 0er 1alsove i #idro"o.ne interak+ije sapovrino antigena

c. &mjeItena su izmeu dvije povrIi unutar 4 domena

d& 3ine i# petlje "orirane od C04 regija /+ i /H doena

e& 6on"ora+ijski se ijenjaju nakon vezanja antigena ili kaptena

2=. &imoidni dijaram ukazuje naJ


13/46

a( 6inetiku alosteri7ki# enzia

b! 4ezanje oksiena na miolobinc! Midiaelis#menten kinetiku

d! +ompetitivnu inibiciju

e! Nekompetitivnu inibiciju

2'. -oveEi aminokiseline u lijevoj koloni sa pripadajuLim proteinima udesnoj koloniJ

Hidroksilizin


14/46

MHC proteini A klase nalaze se na povrIini otovo svake Lelije u vertebrata.o je najpolimor*niji od svi proteina. Antracelularni patoeni su zaItiLeniod antitijela Lelijskom membranom domaLina. /iestija vlastiti i tuiproteina odvija se u citosolu proteosomu. 3 endoplazmatskom retikulumupeptidi se kombinuju sa MHC A i ovi se kompleksi veEu za endoplazmatsku

membranu. &trani peptidi vezani za MHC protein klase A sinaliziraju da jeLelija incirana i markiraju je za destrukciju koju Le izvrIiti citotoksiFne Lelije.&trani peptidi vezani za MHC proteine klase A sinaliziraju da je Lelijaincirana i markiraju je za destrukciju citotoksiFni Lelija. +ompleksJstrani peptid MHC A#receptor LelijeJkoreceptor(C/:! zapoFinju kaskadu ukojoj se lizira incirana Lelija. &tvaraju se velike pore(protein per*orin! uplazmatskoj membrani Lelije domaLina. CitotoksiFne Lelije zapoFinju iproces koji se zove apoptoza ili proramirana smrt Lelije.

2:. NapiIi reakciju kreatin kinaze i objasni ulou ovo enzima uoranizmu.

(+ojoj klasi enzima pripada? +oji je koenzim u relaciji koji katalizira kreatinkinaza? /eniraj pojam izoenzima i objasni dijanostiFki znaFaj izoenzima,kreatin kinaze.!


15/46

@K.str u praktikumu

+reatin kinaza katalizira reverzibilnu *os*orilaciju kreatina pomoLu -.-oloEaj ravnoteEe za ovo reakciju zavisi od pH. Molekula Ck je dimersastavljen iz dva jednaka ili razliFita monomera i molekulskom masom okoKD.DDD. Monomer M(enl.muscle, miIiL! i monomer B(enl.brain,mozak!spajaju se u dimere BB(ili Ck#1!, MB(ili Ck#2! i MM(ili Ck#0! te tako stvarajutri izoenzima. Azoenzimi su multipli molekularni oblici jedno enzima kojiimaju sposobnost da kataliziraju istu ............................ ..... kinaza najviIezastupljena u ............, miIiLima, srFanom miIiLu, mozu. )naFaj ovoenzima se oleda u dijanosticiranju oboljenja ovi tkiva i orana.ktivnost je poveLana kod razliFiti tipova distroje posebno ....., zatimkod akutne miolobumije, maline ipertemije, i nakon teEi miIiLninapora. )a dijanostiku najvaEniji je porast aktivnosti Ck u u in*arktumiokarda, te se smatra da je meu enzimskim testovima, aktivnost C+ userumu najosjetljiviji pokazatelj in*arkta miokarda. Meutim, Finjenica da

aktivnost Ck u serumu moEe porasti nakon davanja ultramuskularnioboljenja, nakon jaFi udaraca i ozljeda, donekle umanjuje speciFnostovo testa u dijanosticiranju in*arkta miokarda. )ato u nejasnimsluFajevima, treba uz aktivnost ukupne Ck treba odrediti njene izoenzime,

jer je za in*arkt miokarda speciFno i poviIenje Ck.MB(Ck#2! izoenzima userumu. Ck#BB se smatra ................... za maline tumore moza, prostate,bubrea i pluLa.

2@. +oji se od navedeni proteoliticki enzima aktivira kiselom idrolizom?

a!ripsin

.(Hiotripsin

c!;lastaza

d!-epsin

e!+arbo%ipeptidaza


16/46

0D. +oji se od dole nabrojani supstanci primarno nalazi uekstracelularnom matri%u?

a!+olaen

b!roponinc!+eratin

d!9ibrin

e()roteoglikan

01. +ako se kod imotripsina prepoznaje specicni supstrat?

a!Anterakcijom ak aktivno mjesta sa supstratom

b!vezanjem N terminalne ak na aktivno mjesto

c!kovalentnim vezivanjem ak ostatka za supstrat

d(6on"oa+ijsko projeno toko vezanja za supstrat

02. )ajednicki aktivator pankreasni zimoena je?

a!ripsinoen

b!Himotripsin

+(tripsin

d!elastin

e!nista od navedeno

00. 9"A(vezano za tripsin!

a!pomocu de*os*orilacije

b!pomocu druo cijepanja

+(poo+u proteinskog in#i.itora

d!sve od navedeno


17/46

e!nista od navedeno

0K. 3loa distalno istidina u miolobinu je?

a!vezivanje $2

b!sprecavanje cvrsto vezivanja $2

+(spre+avanje +vrstog vezivanja CO

d!vezanje za = koordinacijsku poziciju

e(poo+ u odrzavanju ioglo.ina u "ero stanju

0=. +oja je od navedeni tvrdnji poresna?

a!kriva saturacije oksienom za miolobin ima oblik simoide a zaemolobin iperbole

b!anitet emolobin za $2 reulisu oranski *os*ati,dok anitetmiolobina za $2 ne reulisu

+(Heoglo.in ia ve+i a:nitet za O2 od ioglo.ina

d(A:nitet ioglo.ina i #eoglo.ina za O2 ne ovisi o pH

0'. &ta od nabrojano predstavlja svojstvo vezivanja antienaJ

a!smjestene su unutar 2 povrsi unutar 4 domena

.(+ine i# petlje "orirane od C04 regije /L i /H doene

+(kon"ora+ijski se jenjaju nakon vezivanja antigena ili #aptena

d!sadrze ak ostatke koji se kovalentno vezu za antien

e("oriraju nogo.rojne #idrogenske veze,sla.e elektrostatske,van der valsove i #idro"o.ne interak+ije sa povrsino antigena

0


18/46

porrina koji je izoliran iz emolobina .

b!svi triptidni peptidi emolobina & identicni su sa triptidnim peptidimaemolobina

+(jedan izdvojeni peptid u #eoglo.inu S igrira .rze preakatodi


19/46


20/46

e!Olicin

K2.+oja se od dolje nabrojani supstanci primarno nalazi u tetivama?

a(kolagen

b!troponin

c!aktin

d!brin

e!bronektin

K0.-ri zioloskom pH najveci pu*erski kapacitet imace protein koji je boatjednom od sl.aminokiselinaJ

a!"izinom

.(Histidino

c!sparainskom kiselinom

d!4alinom

e!"eucinom

KK.&ta imaju zajednicko tripsin,elastaza i imotripsin?

a(svi sadrze aspartat u aktivno +entru

b!svi vezuju idro*obne aminokiseline

+(sve se sintetisu u pankreasud(svi sadrze kataliti+ku trijadu u aktivno +entru

e!svi sadrze idro*obni dzep za vezivanje supstrata

K=.3 enzimskim reakcijama simoidni dijaram(&!Hb ukazuje naJ


21/46

a!Miscel Menten

.(/ezivanje oksigena na ioglo.in

+(6inetiku alosteri+ki# enzia

d!kompetetivnu inibiciju

e!nekompetetivnu inibiciju

K'.+oja je od sledeci tvrdnji za strukturu AO tacnaJ

a(Ia jesta za vezanje antigena na Ig; olekuli ogu se vezatistr&epitopi

b!medjulancane i unutarlancane veze disuldne stabiliziraju strukturu AO

c!" i H lanci AO sadrze domene sa slicnim strukturama

d!podjedinice AO vezu se za komponente komplementarno puta da bizapoceli put in*.celije

K


22/46

b!kisela sredina u aktivnim misicima omoucava cvrsce vezivanje D2 zaemolobin

+(a:nitet #eoglo.ina za O2 se sanjuje pri visoki kon+&CO2

d!u plucima visoka koncentracija C$2 i H8 omoucava vecu diverencijuemolobina

e(u plu+ia visoka kon+entra+ija O2 oogu+ava otpustanje CO2 iH

[email protected] vrstu celija sa od.karakteristikom u koloniJ

celije pomocniceJ

!-repoznaju klasu AA MHC -R$;AN 8 peptida.,

B!eksprimiraju C/K,

C!stimuliraju B celije.

celije ubiceJ

/!/e*ektuju strane peptide prezivljavajuci na povrsini celije,

;!prepoznaju klasu A MHC proteina 8 peptida,9!eksprimiraju C/:,

O!liziraju in*.celije.

=D.-ovezi tip modicirajuce rupe sa od.ak ostacimaJ

9os*at#r,&er,Ur

Hidroksil#-ro

Oama karboksil#Olu

cetil#N termino

=1.-ostoji @ pozicija u ak sekvenci emolobina razliciti vrsta koje sadrzeinvarijantne ak ostatke.-ovezi i.

a!Olicin 9'#omoucava bliski kontakt B i ; eliksa


23/46

b!Histidin 9:#veze se za em zeljeza

c!"eucin 9K#kontakt s emom

d!9enilalanin C/1#kontakt sa emom

e!-rolin C2#zavrsava al*a eli%

*!irozin HC2#poprecno veze 2 eli%a vod.vezama

=2.Napisi reakciju sinteze metionina iz omocisteina.+oji koenzimiucestvuju u reakciji.$bjasni njiovu ulou.

Metil kobalamin je koenzim enzima metion sintaze koja katalizira sintezumetionina iz omocisteina. $sloboeni B12 reaira sa novom molekulomN=#metil#H9. Hidroksikobalamin reaira sa N=#metil#H9 pri Femu nastajemetil kobalamin i H9. Reakcija je veoma vaEna jer se vrIi reeneracija H9

jer zarobljen u obliku N=#metil#H9 uzrok je perniciozne anemije.


24/46

=0.$bjasni sliku

$pticki test#oksidirani oblik N/8 ima ma% apsorpciju kod 2'D nm,areducirani N/H kod 0KDnm. ko u nekoj reakciji nastaje N/H apsorpcijakod 0KD nm postepeno raste.-orast apsorpcije svjetlosti lako se mjeri itako opticki prati prelaz N/8 u N/H. -orast apsorpcije u jedinicivremena je mjera brzina redukcije i pri zasicenju brzina je proporcionalnakoncentraciji enzima.

=K.+oja tvrdnja o otopini ak pri zioloskom pH je tacnaJ

a(sve ak iaju i pozitivan i negativan na.oj

b!sve ak sadrze pozitivno naelektrisane bocne lance

c!neke ak sadrze samo 8 naboje

d!sve ak sadrze ne.naelektrisane bocne lance

e!neke ak sadrze samo neboje

==.3 raitisu de*ektna je sinteza aminokiselineJ


25/46

a!idroksilizin

b!idroksotripto*an

c!idroksiistidin

d!idroksialanin

e(#idroksiprolin

='.+riva disocijacije $2 normalno adultno emolobina nejekasnije sepomjera udesnoJ

a!mjesanjem adultno empolobina sa *etusnim

.(pove+anje kon+& 2, .i"os"ogli+erata

c!+ooperativnim vez.D2

d!povisenjem pH

;!snizenjem C$2

=


26/46

=@.$bjasni str.karakteristike molekule prikazane na slici i navedi njeneuloe u oranizmuJ

AM je pentamer imunolobulinski podjedinica.-entamer je poprecnopovezan disuldnim vezama. lanac je polipeptid sa Mr.2D DDD.$vaj lanacse nalazi u AM i A.-redstavlja prvu liniju odbrane i to je jedini A kojenovorodjence normalno sintetizira.-ovisen je kod primarne bilijarne

ciroze,virusno epatitisa,in*.parazitima#posebno ranom.+aomem.vezana molekula je monomer,ali u serumu kao sekretorni oblik nalazipoprecno vezan pentamer sastavljen iz = AM monomera.4eoma jeekasan aktivator komplemenata.Nalazi se samo u krvnim sudovima.

'D.minokiselina metionin spada u J

a!polarne nenaelektrisane aminokiseline

.(nepolarne ali"atske ainokiseline

c!aromatske ak

d!bazne ak

e!kisele ak

'1.-lastocijanin spada uJ


27/46

a!likoproteine

b!*os*oproteine

+(etaloproteine

d!emoproteine

e!Vavoproteine

'2.)aokruEi taFan odovorJ

a(6ar.oksilna grupa gli+ina je kiselija od kar.oksilne grupe sir*etnekiseline

b!+arboksilna skupina sirLetne kiseline je kiselija od karboksilne rupe licina

c!p+a vrijednost amino rupe aminokiselina je visa od p+a vrijednosti ?

d!Repulzija odlazeLe protona i pozitivno naelektrisane amino rupe smanjujukiselost karboksilne rupe licina

e!p+a vrijednost karboksilne rupe licina je K,:

'0.ta od nabrojano je netaFno?

a(Na iuni siste proizvede vie od $' na & razli7tii# re+eptora D*elija

b!NaI imuni sistem proizvede vise od 1D na :.razliFiti antitijela

c!NaI imuni sistem proizvede viIe od 1D na : razliFiti receptora Lelija

d(4e+eptori +itotoksi7ni# D *elija i D *elija poo*ni+a e9uso.no se nerazlikuju

e!Receptori .......................................................................................... razlikuju

'K.Ribonukleaza je ali glo.ularni protein koji se.....(ne vidi se sta pise!pankreasau tanko crijevo.&astoji se od jedno...(ne vidi se dalje!

'=. Na slici je prikazana enzimska reakcija.$bjasni reakciju,koji enzim jekatalizira,kojoj klasi enzima pripada?$bjasni ulou te klase enzimaG


28/46

Histidin aonijak liaza


29/46

&lika je J -rezentacija peptida nastali od citosolni proteina.MHC protein klase A(10.slajd na prezentaciji imunoloija!

$bjasnjenjeJMHC proteini klase A nalaze se na povrsini otovo svi celija kodvertebrata.$vo je najpolimor*niji od svi proteina.Antracelularni patoeni suzasticeni od antitijela celijskom membranom domacina./iestija vlastiti i tuiproteina odvija se u proteasomu.3 endoplazmatskom retikulumu peptidi sekombinuju sa MHC proteinima klase A i ovi kompleksi se vezu za plazmatskumembranu.&trani peptidi vezani za MHC proteine klase A sinaliziraju da je Lelijaincirana i markiraju je za destrukciju pomocu citotksicni celija. +ompleksstrani peptid,MHC protein klase A,receptori celija i koreceptori (C/:! zapocinjukaskadu u kojoj se razlaze incirana celija.&tvaraju se velike pore u plazmatskojmembrani celije domacina.

':.spartat spada u aminokiseline saJ

a!nepolarnim bocnim lancem

b!aromatskim bocnim lancem

c!polarnim nenaelektrisanim bocnim lancem

d!pozitivno naelektrisanim bocnim lancem

e(negativno naelektrisani .o7ni lan+e

'@.)aokruzi taFan odovor za Midaielovu (nesto tako,ne vidi se! konstantuJ

a!)a vecinu enzima +m lezEi u podrucju od 1D na prvu do 1D na sedmu mol5l

.(6 ovisi o vrsti supstrata,pH,teperaturi i jonskoj jakosti

c!+m je jednaka koncentraciji supstrata pri maloj brzini reakcije

d!+m je jednaka disocijaciji kompleksa ;& ako je k2 mnoo vece od k1


30/46

e!+m je mjera jacine kompleksa enzim#supstrat pri bilo kojem odnosu k1 i k2


31/46

Na slici su prikazani jonski parovi koji stabiliziraju stanje emolobina. stanjeje stabilnije kada oksien nije prisutan u vezivanju sa emolobinom. stanje jepredominantna kon*ormacija deoksiemolobina. stanje stabiliziraju jonski

parovi koji su najvecim dijelom smjesteni na al*a1beta2 i al*a2beta1medupovrsini.$ve povrsine predstavljaju prekidas izmedju i R stanjaemolobina.#stanje je napeto stanje koje posjeduje centralnu supljinu.onskiparovi na slici su J" podjedinica,"Us C=,sp 9O1,His CH0,Beta podjedinica.


32/46


33/46

d!moze se katalizirati imotripsinom

e!Anibira se djelovanjem proteinsko inibitora

:1.Na slici je prikazan uredjeni sekven+ijalni meanizam reakcije sa visesupstrata

;nzimi koji imaju N/8 ili N/H kao konstituent imaju uredjeni sekvencijalnimeanizam (dalje se ne vidi!

:2.Na slici je prikazana reulacija enzima .$ kojem tipu reulacije se radi?$bjasni

Ne pise objasnjenje niti je dopunjeno

:0.$bjasni meanizam djelovanja N/ koenzima.-rikazi *ormulama reakcionimeanizam nikotinamid koenzima N/8 i N/-8

+oenzimi deidroenaza koji kataliziraju deidroeniranje primarne ili sekundarne

alkoolne rupe .$ni su aktivni oblici vitamina B0.

Meanizam djelovanjaJ -rijenos vodika u oblku idridno jona H# sa supstrata naK C atom piridinsko prstena pri cemu N atom ubi svoj pozitivninaboj.&tereospecicnost reakcije prijenosa H#J supstrat prelazi molekuli N/8 sa

jedne strane i predaje H#X H# koji se sa N/H predaje se druom supstratu potices drue strane piridinsko prstena molekule N/H.9izioloski znacaj J N/5N/Hredoks sistem prenosi elektrone sa supstrata na enzime respiratornolanca.takodje sluzi kao donor H atoma u reduktivnim biosintezama.

-rimjer sa *ormulamaJ liceraldeid #0#*os*at deidroenaza

;nzim posjeduje jako vezujuce mjesto za oksidirani oblik koenzima N/8.Nakon


34/46

oksidacije supstrata ,reducirani oblik N/H napusta enzim.Reoksidacija N/H sevrsi uz pomoc druo elektrona#akceptor sistema.

/#liceraldeid#0#*os*at 8 N/8H# 8 -i ##Q 1,0 bi*os*olicerat8N/H

-iruvat 8 N/H 8 H# #Q laktat 8 N/8

:K.$bjasni sliku

l*a keratinski eliks je desno orijentiran./va eliksa su umotana jedan okodruo i cine superuzvojnicu koja je lijevo orijentiranaNa slici su /va lancasupereliksa su paralelna i vezana preko idro*obni ostataka i tako nastajeprotolament./va protolamenta vezana takodje idro*obnim vezama stvarajuprotobril.

:=./ijaramom prikazi aktivnosti & i " u in*ektivnom epatitisu.

:'.Ne vidi se pocetak pitanja .... nastavak J =mmol5l i 1= mmol5l kompetetivnoinibitora na ipoteticki enzim.+oja kruvlja predstavlja koncentraciju inibitora od1= mmol5l?

$dJA krivulja& $@ olMl kopetitivni in#i.itor


35/46

Slika

:


36/46

:@.+oja od nabrojani karakteristika pripada aminokiselini licin?

a(opti+ki reaktivna

b!velika molekula koja se ne moze uklopiti u al*a eliks

c!Hidrolna,naelektrisana i bazicna

d(#idro"o.na

d!povecava 4ma%

e!povecava 4ma% i povecava +m

@1.+oji se od nabrojani enzima reulira primarno alosterickom interakcijom?

a! ne vidi se i tacno je pod a

b!piruvat deidroenaza

c!likoen *os*orilaza

d!likoen sintaza

e!spartat transkarbamilaza

@2.3loa distalno istidina u miolobinu je J

a(poo+ u odrzavanju 8. u "ero stanju

b!&prijecavanje cvrsto vezanja C$2

c!4ezanje za petu koordinativnu poziciju 9e

d(sprije+avanje +vrstog vezanja CO

e(vezanje O2


37/46

@0.+oja od sljedeci tvrdnji je tacna?

a!+riva saturacije oksienom za miolobin ima oblik simoide a za emolobiniperbole

.(a:nitet #eoglo.ina za O2 regulisu organski "os"ati,dok a:nitetioglo.ina za O2 ne regulisu

c!emolobin ima veci anitet za $2 od miolobina

d!anitet miolobina i emolobina za $2 ne ovisi od pH

e! i C

@K.+oja je od sljedeci tvrdnji tacna?Hemolobin & *ormira percipitate?

a(zato sto valin u pozi+iji % .eta lan+a stvara ljepljive #idro"o.nepovrsine

b!koji su reverzibilni prilikom oksienacije

+(koji ijenjaju o.lik eritro+ita

d(sao u deoksi "ori

e!samo kod omoziota

@=.&ta od navedeno predstavlja svojstvo mjesta vezivanja antiena?

a!smjestena su izmedju dvije beta povrsi unutar 4 domena

.( +ine i# petlje "orirane od C04 regija /L i /H doena

+(ko"ora+ijski se ijenjaju nakon vezivana antigena ili #aptena

dalje se ne vidi


38/46

1. ta od nabrojano predstavlja svojstvo mjesta vezivanja antiena ? provjeriti

a! &mjestene su izmedju dvije B povrsi unutar 4 domena

b! Yine i petlje *ormirane od C/R reija 4" i 4/ domena

c! +on*ormacijski se mjenjaju nakon vezanja atiena ili aptena

d! &adrEe aminokiselinske ostatke koji se vezu za antien

e! 9ormiraju mnoobrojne idroenske veze , slabe elektrostatske , van derZalsove i interakcije sa povrsinom antiena

2.+oja (koje! od sljedeci tvrdnji ukazuje da se emolobin & razlikuje odemolobina zato sto je lu:tamat zamjenjen sa valinom na poziciji ' B lanca?

a!-orrin koji je izoliran iz emolobina & ima jedan ostatak valina vise odporrina koji je izoliran iz emolobina

b!&vi tripticki peptidi emolobina & identicni su triptickim peptidimaemolobina

c!edan izmjenjeni peptid u emolobinu & mirira brze pema katodi (#! neoodovarajuci peptid emolobina

e! Azoelektricna tacka emolobina & malo je niza od izelektricne tackeemolobina

0. -ovezi odlike miolobina u lijevoj koloni sa njiovim od.osobinama u desnojkoloniJ a!*erimiolobin 1. 9e u 82 oks.stanju


39/46

b!oksimiolobin 2.9e u 80 oks.stanju

c!deoksimiolobin 0.$ksien vezan za ' koord. poz.

K.' koordinativna pozicija prazna

=.H2$ vezana za ' koordinat.poziciju

'.Histidin na = koordinat.poziciji

a#2,=,',

b#1,0,',

c#1,K,'.

K.ta je predstavljeno na slici ?

Na slici je prikazan MHC 1 protein.MHC proteini klase 1 imaju nevarijabilni B lanac(B2 mikrolobulini! i varijabilni "#lanac .$ba su smjestena e%tracelularno.&vakicovjek stvara ' razliciti " lanaca za klasu 1 MHC proteina.)naci da B lanac ne

ucestvuje u *ormiranju ipervarijabilno reiona odnosno mjesta za vezivanjeantiena. MHC 1 proteini nalaze se na povrsini celija kicmenjaka .+ada stvoripeptid dospije u cistol , oni se kombiniraju sa proteinom MHC1 te kao takvi vezuse sa vanjske strane celijske membrane kao sinali za kaskadni proces .

=.Napisi rakciju alanin aminotrans*eraze .+oji koenzim ucestvuje u reakciji?$bjasni njeovu ulou ?

Meanizam prenosa amino skupine pomocu alanin aminotrans*eraze odvija se uzpomoc koenzima piridoksal *os*ata .


40/46

-ri reakciji transaminacije, a.k. i piridoksal *os*at , koji je vezan za enzim ,stvaraju bazu .Mezo.......... , pomakom dvostruke veze i idrolizomdolazi do izdvajanja 2 okso kiseline , a piridoksal *os*at ostaje vezan za

enzim.-iridoksalni *os*at dalje reauje sa "#oksolutaratom dajuci bazu.Nakon pomaka dvostruke veze idrolizom se oslobadja lutamat .

'.ta je predstavljeno na dijaramu ? $bjasni promjenu kineticki parametara nadatoj slici .

/ijaram predstavlja enzimsku kinetiku u prisustvu i bez kompetitivno inibitora. Moze se konstatovati da ezivanje kompetitivno inibitora na aktivno mjesto uenzimu umjesto supstrata dovodi do promjene Micaellsove konstante kojapredstavlja odnos supstrata i enzima ( ako je k0 k2! jacine njiovovezivanja kao i njiovo aniteta , sto je kM manje to se supstrat labavije veze iima manje aniteta .3 kompetitivnoj inibiciji kM se povecava , 4ma% ostajenepromjenjeno .)nacajka ovo vida inibicije jeste sto se moze sprijecitikoncentracijama supstrata.

154 6 +m 54ma% 7 15Cs 8 15 4ma%

7 1 5+m odsjecak na apcisu

15Cs odsjecak na ordinatu


41/46

rupom.-roton sa C2 atoma dovodi svojom disocijacijom do nastanka karboniumjona ( anjona!.

:.3 raitisu de*ektna je sinteza aminokiseline

a!isroksitripto*ana

b!idrosksitirozina

c!idroksiistidina

d!idroksialanina

e!idroksiprolina

@.+riva disocijacije oksiena normalno adultno emolobina najekasnije sepomjera nadenso

a!Mijesanjem adultno emolobina sa *etusnim emolobinom

b!-ovecanjem koncentracije 2,0 bis*ospolicerata

c!+ooperativnim vezanjem oksiena

d!-ovisenjem pH

e!&nizenjem C$2

1D.+oja od sljedeci tvrdnji o strukturi AO je tacna?


42/46

a!Na dva mjesta za vezanje antiena na AO molekuli mou se vezati strukturnorazliciti epitopi

b!Medjulancane i unutarlancane disuldne veze stabiliziraju strukturu AO

c!"i H lanci AO sadrze domene sa slicnim strukturama

d! +omponenta komplementarno puta veze se za 9c podjedinicaAO

e! 4ezanje AO za specicni antien odredjuju samo ipervarijabilne reije "lanaca

11. +oji od sljedeci odovora korektno zavrsava recenicu ? provjeriti

Hemolobin se razlikuje od miolobina po tome stibilno se

a!Miolobin je multimer , a emolobin monomer

b!Hemolobin veze $2 mnoo cesce od miolobina pri bilo kojoj koncentraciji $2

c!4ezanje C$2 za emolobin mnoo je ekasnije neo za miolobin

d!4ezanje $2 za emolobin zavisi od koncentracije C$2 H8 i B-O , dok vezanje$2 za miolobin ne zavisi

12.$bjasni sta je prikazano na slici i obiljezi pojmove na predvidjenim mjestimana slici.

Na slici je prikazan prostorni raspored kljucni aminokiselinski ostataka oko


43/46

ema miolobina.$2 idroenskom vezom povezan oksitalni istidin .9unkcijaprostetske upe modelirana je njenom okolinom.4ezivanja $2 za em ovisi i odmolekularno kretanja , osnosno disanja proteinske strukture .Modelmiolobinsko vezivno mjesta za kisik pokazuje em, proksimalni istidin (9:! idistalni istidin (;

ostacima . $sim 2 istidina 9: nalazi se na =. koordinacijskom mjestu i on se zoveproksimalno vezivno mjesto za kisik je na druoj strani ema.Na '. koordinativnuvezu 9e28 ema u emolobinu i miolobinu reverzibilno se vezuje molekulskikisik .

10.Napisi reakciju aspartat#aminotrans*eraze. +oji koenzim ucestvuje u reakciji?$bjasni njeovu ulou?provjeriti je li 2#okso i "#okso i &CHA99$N B)

Meanizam prenosa amino skupine pomocu alanin aminotrans*eraze odvija se uzpomoc koenzima piridoksal *os*ata .

-ri reakciji transaminacije, a.k. i piridoksal *os*at , koji je vezan za enzim ,stvaraju &ci>on bazu .Mezo.......... , pomakom dvostruke veze i idrolizom dolazido izdvajanja 2 okso kiseline , a piridoksal *os*at ostaje vezan zaenzim.-iridoksalni *os*at dalje reauje sa "#oksolutamatom dajuci &ci>on bazu.Nakon pomaka dvostruke veze idrolizom se oslobadja lutamat .

1K.reonin spada u aminokiseline sa J

a!Nepolarnim bocnim lancem

b!polarnim bocnim lancem

c!-olarnim nenaelektrisanim bocnim lancem

d!-ozitivno naelektrisanim bocnim lancem

e!Neativno naelektrisanim bocnim lancem


44/46

1=.)aokruzi tacan odovor J

a!p+a karboksilne rupe licina je 2,0K

b!+arboksilna skupina sircetne kiseline je 1DD puta kiselija od karboksilne rupeaminokiselina

c!Repulzija odlazece protona i pozitivno naelektrisanje amino rupe smanjujekiselost karboksilne rupe licina

d!p+a vrijednost amino rupe licina je 1D,'

e!p+a vrijednost amino rupe licina je @,2D

1'. -rikazi rezonantne oblike peptidne veze J

1


45/46

l*a keratin spada u (brilarne ! proteoliticke proteine.Clan je velike *amilijeproteina koji se zovu ( proteini intermedijarno ....................!. l*a keratinskieliks je (desno! orijentisan./va lanca eliksa su umotana jedan oko druo i

cine (superuzvojnicu! koji je (lijevo! orjentisan ./va lanca (supereliksa ! suparalelno povezana preko (idro*obni! ostataka.

1@.$bjasni strukturne karakteristike molekule prikazane na slici i navedi njeneuloe u oranizmu.

AM imunolobulini koji se prvi sintetise u imunom odovoru.edini je pentamer.Ama 1D mjesta za vezivanje antiena .-oprecno jepovezan disuldnim vezama , asadrzi i veze koje povezuju teske lance. A lanac ima Mr #2DDDD.Nalazi se samo ukrvnim sudovima.edini A koje novorodjence normalno sintetizira.4eoma jeekasan aktivator komplemenata.-ovisen je kod bilijarne ciroze ,virusnoepatitisa,in*ekcije parazitima.

2D,Nekompetetivni inibitorJ

!povecava +m bez promjene 4ma%B!&nizava +m i snizava 4ma%C(Snizava /a>/!-ovecava 4ma%;!-oveceva +m i povecava 4ma%

21.


46/46

Documents

I Parcijala