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Filogenia – Árboles filogenéticos
Filogenia – Árboles filogenéticos
Filogenia
Filogenia – Árboles filogenéticos
Filogenia y genealogía
Filogenia – Árboles filogenéticos
La filogenia reproduce la trayectoria evolutiva del taxón
Filogenia – Árboles filogenéticos
Un árbol evolutivo es una hipótesis
Filogenia – Árboles filogenéticos
Filogenia basada en la morfología
Filogenia – Árboles filogenéticos
Filogenética
Filogenia – Árboles filogenéticos
Árbol basado en caracteres morfológicos
Filogenia – Árboles filogenéticos
Datos moleculares vs. datos morfológicos
Filogenia – Árboles filogenéticos
Análisis filogenético
Filogenia – Árboles filogenéticosUn árbol filogenético es un gráfico bidimensional que muestra
relaciones evolutivas entre organismos o, en el caso de secuencias, entre determinados genes de diversos organismos.
Árbol filogenético
Gene tree
Species tree
Filogenia – Árboles filogenéticos
¿Para qué se puede utilizar la filogenética?
Filogenia – Árboles filogenéticos
The tree of life vs. the web of life
Filogenia – Árboles filogenéticos
Filogenia – Árboles filogenéticos
Terminología (1)
Filogenia – Árboles filogenéticos
Terminología (2)
Filogenia – Árboles filogenéticosLos nodos terminales
(hojas) representan a los distintos taxa. Todos ellos
son contemporáneosCada una de las
unidades filogenéticas representadas en el árbol es un taxón (plural taxa)raíz
Estructura de un árbol filogenético (1)
Nodos terminales
(hojas)
La raíz representa al “último ancestro común” del que
derivan todos los taxa representados
en el árbol
Filogenia – Árboles filogenéticos
Nodos internos
Las relaciones entre los distintos taxa se indican mediante nodos y ramas
Cada nodo es una bifurcación de la
ruta evolutiva que da lugar a dos
especies distintas.
De cada nodo surgen dos ramas (árbol binario), que evolucionarán de forma
distinta.
ramasLa longitud de cada rama representa el número de
cambios producidos antes de llegar a la
siguiente bifurcación
Estructura de un árbol filogenético (2)
Filogenia – Árboles filogenéticos
Estructura de un árbol filogenético (3)
Filogenia – Árboles filogenéticos
El grupo externo y los clados
raíz
Grupo externo
Clado (equinodermos)
Ancestro común del clado
Filogenia – Árboles filogenéticos
Clados y cladogramas
Un clado es un conjunto de especies emparentadas
(que comparten un antepasado común). Su
representación gráfica se denomina cladograma.
Varios clados se pueden agrupar en un clado de
orden superior
Filogenia – Árboles filogenéticosUn cladograma se puede
representar de muchas maneras. Lo único que importa es el orden en el que se suceden las diversas
bifurcaciones, es decir, su topología. Todos los cladogramas de esta figura son equivalentes.
Topología del árbol
Filogenia – Árboles filogenéticosLa forma del árbol y
las bifurcaciones que contempla constituyen
su “topología”.
Estos cuatro árboles son equivalentes. Se puede rotar cualquier nodo interno sin que cambie la topología
porque esta operación no cambia el
agrupamiento de las especies.
Topología del árbol (2)
Filogenia – Árboles filogenéticos
Filogenia – Árboles filogenéticos
La flecha del tiempo
Filogenia – Árboles filogenéticos
Cladogramas y filogramas
Filogenia – Árboles filogenéticos
En un cladograma, la longitud de las ramas no contiene
ningún tipo de información. Sólo indican en qué orden se
sucedieron las ramificaciones.
En un filograma, la longitud de las ramas es proporcional a la divergencia. Suelen incluir una escala que indica los cambios
acumulados con el tiempo.
Cladogramas y filogramas
Filogenia – Árboles filogenéticos
Con moléculas: la hipótesis del reloj molecular
Filogenia – Árboles filogenéticos
El citocromo c es un reloj molecular
Filogenia – Árboles filogenéticos
Inconvenientes de la hipótesis del reloj molecular
Filogenia – Árboles filogenéticos
El registro fósil es el mejor reloj evolutivo
Filogenia – Árboles filogenéticos
Filogenia con escala temporal
Filogenia – Árboles filogenéticos
El registro fósil ayuda a construir o modificar árboles filogenéticos
Filogenia – Árboles filogenéticos
Tipos de árbol
Filogenia – Árboles filogenéticos
Árboles con raíz y sin raíz
Filogenia – Árboles filogenéticos
Anatomía de los árboles filogenéticos
5 nodos terminales (OTU)
Nodos internos
Ramasn externas
(n-2) internas
nn-1
2n-2 2n-3
nn-2
n externas
(n-3) internas
Filogenia – Árboles filogenéticos
Árboles con raíz
Un árbol evolutivo con raíz muestra las
relaciones evolutivas que hay entre
secuencias que proceden de un mismo
ancestro y el orden cronológico en que tuvieron lugar las
diversas ramificaciones. También puede mostrar qué especies presentan una velocidad evolutiva
elevada.
Filogenia – Árboles filogenéticos
Árboles sin raíz
Un árbol evolutivo sin raíz también muestra
las relaciones evolutivas que hay entre las diversas
secuencias pero no especifica la ubicación
del último ancestro común ni el orden temporal en que
tuvieron lugar las diversas
ramificaciones. La longitud de cada rama
es proporcional a la distancia evolutiva.
Filogenia – Árboles filogenéticos
Árboles escalados y sin escalar (1)
Filogenia – Árboles filogenéticos
Árboles escalados y sin escalar (2)
Filogenia – Árboles filogenéticos
Posibles combinaciones
Filogenia – Árboles filogenéticos
Bosques filogenéticos (1)
Filogenia – Árboles filogenéticos
Bosques filogenéticos (2)
Filogenia – Árboles filogenéticos
Árbol verdadero y árboles inferidos
Filogenia – Árboles filogenéticos
El formato Newick
