Introduction:

La structure dune protine est une organisation hirarchise comportant

plusieurs degrs de complexit croissante

Cest lenchainement des AA les uns pres les autres

Sous linfluence des forces attractives ou rpulsives qui se manifestent tout au long de

la chaine linaire dAA la protine ne conserve pas cette structure et subit vite une

volution trimentionelle en structure

secondaire , tertiaire, quaternaire

Conduisant une conformation spatiale bien

dfinit :PROTEINE NATIVE

A / HELICE :

-structure en btonnet

-La chaine polypeptidique enroule forme la partie interne du btonnet et les chaines latrales se disposent lexterieur en un arrangement hlicodal

-lhlice est stabilise par des liaisons hydrognes entre les groupes NH et CO de la chaine principale le groupe CO de chaque AA est li par liaison hydrogne au groupement NH de lAA qui est situ 4 rsidu plus loin dans la squence linaire ( la liaison H est de 2,8A de long)

-chaque rsidu est dispos / au suivant selon une translation de 1,5A le long de laxe de lhelice et une rotation de 100 ce qui donne 3,6 rsidus /spire

-le pas de lhelice est de 5,4A (Pr. Globulaire) et de 5,1A(Pr. Fibreuse)

-tous les grp CO sont orient presque paralllement vers lavantde la squence et tous les grp NH sont orients vers lamont

B/ feuillet ou pliss:

-la chaine polypeptidique est tire au lieu

detre troitement enroule comme dans lhlice

-la distance axiale entre AA adjacent est de

3,5A et non 1,5A comme dans lhlice

-la priodicit est de 7A

-il est stabilis par des liaisons hydrogne entre

les gprt CO et NH de diffrentes chaines ou de

de diffrente section de mme chaine

polypeptidique

-on a 2 types suivant le paralllisme et

lantiparallelisme des chaines

Rsultat de lassemblage

des formes lmentaires

de type ou

selon les trois

directions et

par le pliage

des chaines

Le tout est stabilis par des interactions de type

non covalentes

(liaison ionique,

hydrogne,

de vanderwaals)

et des ponts

disulfures

On a quatre types de motifs:

* le tout

* le tout

* l /

* l +

Cest la disposition des chaines tertiaires en sous units identique les unes par rapport aux autres: les

protomres constituent les oligomres.

Ils sont stabilises par des liaisons ioniques,

dhydrogne, de kausmann, et des forces de van der waals

Ce nest pas une organisation immuable cest un tat dquilibre entre lassociation et la dissociation partielle des protomres

Ltat dquilibre est sous laction des facteurs extrieurs appels facteurs allostriques il ya transition entre la forme relche ou R inactive et la

forme tendue ou T active