DNA Ligation Tips BioInform Journal 5

  • Upload
    motiba

  • View
    218

  • Download
    0

Embed Size (px)

Citation preview

  • 8/18/2019 DNA Ligation Tips BioInform Journal 5

    1/2

    ו ט נ ו י ש ן ו ל ש י תÆ כ ל כ ס ת ה מ י ו ו ם ח י ת א ל ו DNA ה י ט ק ט מ ו י שר ח ז מ א ג י ם ל י ז נ א ה ה ה¨ ש י צ ג י ל ת ה י י צ ק א י ר ת ל ו ר ו ש ק ת ה ו י ו מ ר לה ו ו ק י מ נ יÆ א ט נ נ י מ ו ק ן® ר ו ל ט©ק ר ש צ ו י ת ו ו נ ו DNA ש ת ו ל ו ק ל ו ו מ ז ו ל זל ה ש ח ל צ ה ר ה ו י ת ש ו א ר פ ש ן י ל ה ל ה ש י צ ג י ת ל ו י צ ק א י ר ם ל י פ י ט ה

    Æם כ ל ם ש י ט ו י ש

    נ ט נ ק מ ז ל א ג י ל ר ה פ ק א ב ל ≈ ח

    א פ ק ך ה ̈ם א י ז נ א ל ה י ע פ י ל נ י א ח ז ה א ג י ר ל פ ב א ב צ מ נ ה≠ATP ה ÄTP≠ק ה ר י ע א פ נ מ י ל ד קÆ כ ר פ ה מ ל ל ר ר ג ז ר ח ש פ הÆה ד ב ע מ ע ל ג ם ה ד ע י aliquots® מ © נ ט נ ק מ ז ל א ג י ל ר ה פ ק א ב ל חד י פ ק דÆ ה ח ש א מ י ר ש ח א ן ל ק א ר ז י ל ד ק כ י פ ס נ מ ט נ ק נ מ י כ ה

    Æב ט י ב ה ב ר ע י ר מ ג ר ל ש פ ה ר ש ח א ק ל ר ר פ ב ק א ה ל ח ל

    ATP פ י ס ≈ ה

    ה י ג ל י ל ב נ ש י ש צ ק י ל פ א ם ב ב י ש מ ש נ מ א ̈ז ש א ג י ם ל י ז נ א̈ן כ גT¥ ß©א א פ י ר ט ק ם≠ ב י ק ד י י ל ח ם ש י ס ס מ ר י ר ב ק י̈ מ ר ל ק ל מ ע ב ט ז ב א ג י ל ל ה ט כ ע מ כ ד ש ע ¥Æ®T ב DNA ז א ג י א ל ר ק ם נ י ז נ אא צ מ ז נ א ג י ר ל פ ם ב ÆATP א ץ ח ¥T נ ז א ג י ל ̈ם ל ל י ע פ NAD ל ם י ש ר ד ל י ש פ ז ס כ י ר ד ל י ע ר ATP ט כ פ ל י ס ̈ה ה נ ש ר מ ם י כ ד ב ע מ d̈eoxyriboATP ן כ ̈ד ש ב ל riboATP ב ש ב≠ מ ש ה ד ל י פ ק Æ∞Ƶ mM ה

    Æל ע פ א י ט ל ש י P̈CR פ י צ ק א י ר ש ל מ ש מ הכ י ר ח ח א ק א ה≠DNA ל נ ך ל ר ן צ י ̈ן א מ ך ז ס ח י ל ד ̈ךכ ל כ ף ע ס נ ר י ש ה י י צ ג י ל ע א ה צ ב ATPל ף י ס ה ר ל ש פ ה∫ א י צ ק י ר ט י ס מ י ז נ א̈ה י צ ק י ר ט ס ר י ה מ י ז נ ל א ה ש י צ ב י ט ק א נ י ע א צ ב ח ל כ ש ל הÆ א נ ח ב מ ה ה א ב

    כ ° ח י ב ש ה י י צ ק י ר ט ס ר י ה מ י ז נ ̈ר א ב ח ז י א ג י ל ה ה ש ̈ן מ א כ ם ל א ש

    ה י צ ג י ל י ה נ פ DNA ל ה י ע ט ק מ א מ מ ≈ ח

    ה ל י ח ב ב ר ̈ם ע י ק י ב צ ד ם ק DNA ע י ע ט ק ל מ ה ש י צ ג י ע ל צ ב י ל ד כ ≥ ך ש מ ם ב≠ µ°C∂ ל מ א מ דÀר©insert®ח ח ֶ מ ר©vector®ה ט ק א ה ר ט ק ר ל ט ק ן י י “ ב מ י נ ”פ י צ ק א ר ט נ י ם א ר ה פ ם ז מ י ב ח ל ק Æ ש דר ב י ח ע ה י נ י מ ד ל י ה ע י צ ג י ל ר ה ע י נ א ש י ט ק מ ̈ר ה ד ח מ ר ל ד ח ן מ י בDNA י ע ט ק ל מ ט ש ב י ש ד ב ח י מ ב ב ש א ח ה ה פ ז י רÆ ט ט ק ר ל ד ח ל מ שם י ר צ י ם ה י נ ם ש י מ י ז נ י א נ י ש ד ל י ̈ד א ע ח ה א י צ ק י ר ט ס ם ר י ז נ י א ד ל י ע ÆBglII≠ BamHI י ד ל י ט ע ב י ש מ ב ̈ה כ ז ה ל ם ז י ר ב ח מ ם ה י ק י ב צ ד קר ג ס י נ ד י מ ס ל פ ב ה≠DNA ה ̈ר ר ק ר ב מ ש ה≠DNA נ ן ש י כ ז̈ מ ה כ מ ג ד ב DNA ל ר ש צ ם ק מ י םÆ ח י י ר א נ י ם“ ל י י ר מ י ל ם”פ י נ ב ר מ צ ר י ד ח מ מ̈ ה צ ל ע ע Æ ח פ ם ל י י נ י ש ה פ י צ ג י ל ר ה ע י ה א ש ל ע ה י ז ה ל ם ז י ר ב ח מ צ ה ל ק ע ב ÆÆÆז א ג י ל פ ה ס י ה נ פ י ה≠DNA ל ע ט ק ב מ ר ע ר א ר ק ח ל כ ש ל ך א א

    ם ח י ד ל י ז ע א ג י ל ל ה ה ש י צ ב י ט ק א נ י ע א צ ≈ ב

    ם מ י י ח ד ל י ה ע י צ ב י ט ק א נ י ע א צ ב ה ל צ י ל מ Fermentas® מ ס© ט נ מ ר ר פ ב חק ם©∞± ד י ק ד י י ח ך ה ה ל י צ מ ר פ ס נ ר ט י ה נ פ ה ל י צ ג י ל ב ה ר ע ל של י ע ד א י א ר מ פ ש ר מ ב ד ה נ ש ע ק ב≠C°∞∑®¨ט µ ד µ°C∂ א ב≠ פ י ט א ה ©ר ר י ה ך ז ̈ה א צ ל מ ה ט ל ל ח ה ף ב ר ט צ י מ נ הÆ א י צ מ ר פ ס נ ר ט ה

    Æ®א ב ה

    ל ק י ל ן ג ל י א י ל פ ש ב מ ש ≈ ה

    ם“ י פ פ צ ם”מ י נ כ מ ם ה י ר מ ח צ ה ב ק ך ל י י ל©PEG® ש ק י ל ן ג ל י א י ל פ ̈ה נ ח ב מ ב ב ח ר מ ל ה ס א כ פ י ה ב פ ר ד י ר ה מ ה ח Æ®crowding ז agents© Æ י מ י מ ה ה ז א פ ה ב י צ ג י ל י ה י צ ק א י י ר ב י כ ר ל מ ם ש ז כ י ה א ר ל ע ך מ כח פ נ ה≠ATP ב ז א ג י ל י ה≠D̈NA ה ע ט ק ף א מ פ צ ̈ PEG מ ר ח ם א י ל י מ בל ̈ר כ ב ל ד י ש מ א הÆ ל י צ ג י ל ל ה י ע ד א י א ל מ י ד ג ך מ ד̈כ א ן מ ט קר ב P̈EGח ם י ל י כ Rapid® מ ligation kits ה© ר י ה ה מ י צ ג י ל ם ל י ט י ק הי ד ל•∞PEG ¥∞∞∞ µ כ ה ש ס י מ ם ל ע י ג ז ר א ג י ק ל פ ס ף מ ס א ט נ מ ר פ DNA ז א ג י ח ה≠P̈EG ל כ נ ם©Æ®blunt ב י ה צ ק ל ק ה ש י צ ג י ר ל פ ש לם י ר ט פ ד ̈ם א י ה ק ם י ק י ב צ ד ר ≠ ק ב ל ד ט כ ע מ ר“ כ פ ”ל ל כ ¥T יÆר ד ח ר ה ט ר פ מ ט ד ב ב ל ק ב א ב≠µ ד ל ז RNA≠ DNA≠כ ̈ם י ר ק נ י לז א ג י ל ל ל ש י ע י מ ה≠PEG ל ר ם א י מ י ג ד ם מ י ק ר ם מ י ר פ י י ס נ של כ נ י י DNA מ≠E. coli. א ז א ג י ל ם ש י ר ק ר ח ב ם ס י נ ךµ± ש ש מ ÆDNA בח כ P̈EGנ ח כ נ ה ב י צ ג י ל ע א ה צ ב ס ל י נ ד ש ̈ם ע י ה צ ק ר ק ב ח לח א פ ם ל י ה צ ק ר ק ש ר ב≠E. coli ק ק מ ז ש א ג י ל ̈ה ה ל ם א י א נ ב ש

    ÆT¥≠ר ב ק מ ז ש א ג י ל ב מ ט ד א ש מ י ג א ר DNA מ≠¥T ה ז א ג י י ל ע כ ד ע∫ י י פ ר מ ח א ר ה פ י ס ה ח כ נ ב ש

    ר ר ב ה

    Ʊ∞∞ mM ≠מ

    ר י

    ל ש

    ז כ י ר ב

    K´≠

    Na´ ם י נ י ט ק ל ל י ע ם א פ י ר פ ש ̈ז מ א ג י ל א א ה כ ד ם ל ק מ ̈ן ב ג ל ש א ה ן ר נ P̈EG ה

    ÆÆÆה מ י כ פה∫ ל א ל ה ב ג מ ן א ה ב ש ח א ב י ב ל ה≠P̈EG ה ה ש ל ד ג ל ה י ע ף י ר ח

    ע צ מ א PEG ב ה ל י כ מ ה ה י צ ג י ב ל ר ע ה ל י צ ב י ט ק א נ י ש א ע ן ל י • אÆה י צ מ ר פ ס נ ר ט ל ה י ע י ע ב ג פ א ל י ל ד ̈ם כ ח

    ע ג פ א ל י ל ד ה ≠ כ ע ש ר מ ה PEG י ל י כ מ ה ה ס י מ ה ב י צ ג י ר ל י ג ד ה ן ל י • אÆה י צ מ ר פ ס נ ר ט ל ה י ע י ב

    ̈ה י צ ר פ ר ט ק ל א ר ל י ש ל PEG י י כ מ ה ה י צ ג י ב ל ר ע ש ב מ ש ה ן ל י • אק א נ ש ל ה י י צ ר פ ר ט ק ל א י ה נ פ י ה≠E. coli ל ק ד י י ג א ח ר ה א ל י ל ד כ

    Æל נ א ע ב ק י DNA א ש י ק י נ ט ל י ר ק ז ע ה ב י צ ג י ל ב ה ר ע

    מ “ ” י“ א ”ח ז א ג י ל ם ה ה א ר י ה ה מ ק י ד ק ב ד ≈ ב

    ל ב ק א מ ן ל י י ד ה ע י צ מ ר פ ס נ ר ט ה י צ ג י ל ל נ ש י ס י ה נ מ ר כ ח א ם ל א

    י ק ס צ‘ב י ד ר י ב נ ג ב ר י ל ו ק ל ו ה מ ג ו ל ו ב פ ב ט ה ה צ ל ק ם ע פ ט

    ל ש

    ה צ ג ל ל

    ם פ ע DNA ט ט ק מ

    2010 ר ב ט ק ן5 א י ל י Bio ג Inform |36 |

  • 8/18/2019 DNA Ligation Tips BioInform Journal 5

    2/2

    ± ≥≤ ¥

    ק∫ ד ב ש ל ̈ם י י ט נ מ ר פ ס נ ל ר ב ש ש מ ל ב ק י ל ד ם כ י י ט נ ט פ מ ק ק י פ ס ם מ ם ה א םø ה י ם א מ י י ם ח י ק ד י י ח ם ה א • ה

    øה י צ ג י י ל ר ח ד א י מ ס ל ø מ י א מ ב ן ט ם ה י ק ד י י ח ל ה ד י ט ג ל ם פ א • ה

    ע צ ה∫ ב ט ש ה פ ק י ד ב ן¢ ©ה ¢כ א י ל ה א ש י ה ש ה ל ב ש ם ה א

    ם ק א ד pUC±π®¨ ב ד י מ ס ל ל פ Ʊng∞ ש ם ר ע ק י י ב י צ מ ר פ ה®Æס ט מ א ל ”מ “ ©ר י“ א ”ח מ צ ז ע א ג י לא ה ל ם©ז י מ י א י ה≠DNA מ ע ט ק צ מ ם ק ק א ד א∫ ב י ר ב י ז ח א ג י ל ם ה א

    ן∫ א כ י ה ה ב ש ם ה ל®Æא ל ט כ ש פל י כ א מ ם ה א י® א ה ג ל י ב ן ה ב מ ם©ב י ק ד י י ח ל ל י ע ם ה≠DNA ר א • הøר ח ם DNA א ש ר א ל ב ח א י ם ל ל ע ב ז ש א ג י ם ל ש ̈ה ש ז י כ מ י ך“ כ ל כ ”ל ± μ l ח י∫ ק ד מ ט ל ש א פ ”מ “ ה י“ א ”ח ז א ג י ל ם ה ה א ק י ד ב ל ל ק ט ר פפ י ס sample®¨ ה buffer י ל ̈ר ב מ ל ע©כ ב א צ ל ר DNA ladder©DNA® ל ק ר מג‘ל צ ב י ר ן“ה ח ל ש ל ה ”ע ק ר כ≠∞± ד י ג ד ̈ם ה י מ ז א ג י ̈ז ל א ג י ר ל פ ל ב ̈ה כ ל ה ל כ ע ז פ א ג י ל ם ה ר ®Æ א ק י ב ז©כ א ג י ל ל ב פ א ט ל ר ש ק ר ל מ ז מ ר ג א

    Æ®±ר י ד©א ח ש א ג ך ל פ ה ל ם ל ע י ה ך ל י ר ר צ ק ר מ ל ה ב“ ש ק ע ם י ל ”ס

    ז א ג י ל ה ע מ נ מ ך ה ל כ ם ל י י ם ק א ה: ה ר י ה ה מ ק י ד ק ב ד ≈ ב

    ל ע פ ל

    ל ה ש ק י ד ב ל ה ק ט ר פ ש ב מ ש ה ש ל י∫ י ד מ ה ל ט ש א פ י ז ה ה ק י ד בנ ח ב מ ך ל ר±®ª א י ם©א ד ק פ ה י ט י ב ר א י ̈ז ש א ג י ם ל י ז נ א נ ה י קÆך ל כ ל מ ד כ ש ח ף א ה≠DNA ה י ס ה ש ל ̈ז י א ג י ל ה א ה ל י כ מ ̈ן ה ח ב מ ה DNA≠ה י ש ר ̈ע ה ג פ י ל ע פ D̈NA א ש ר ק ר ר מ פ א י ז ל א ג י ל ם ה א

    Æה י צ ג י י ל י צ ק א י ר ם ל י מ י א ם מ נ י א ם ש י ר מ ח ם ב ה ז מøז א ג י ל ל ה י ע פ ע ב ג פ ם ל י י ש ם ע י ר מ ל ח י א

    Æם י י כ ר ד≠ע ם ח י נ י ט • ק

    Æז א ג י ל ל ה י ע פ ם ל י צ ח נ ́≥Mg ה י ה≠ נ ד א י כ ל ËDTA ה •

    chaotropic י© פ ר ט א ח ק ל ל מ ש ס מ ז מ ר ג ל א ם ש י ר י י לª ש נ לª א נ • פÆ נ ט ש י ש DNA ב י ע ט ק ל מ י ש ק י י נ ר ח ם א י ר א ש נ salt) ה

    ÆNanoDrop Spectrophotometer ר ז ע כ ה≠DNA ב י ם א א י ק ד נ ב ב ר ל ח ש ט א ב צ מ י ה י ל ל א∞≤≥Ø∞∂≥ע ה ה ר ז י ש כ מ ם ב י ק ד נ ב א ס ש ח י ה DNA≠ק א ה נ ץ ל י ל מ י מ נ ח מ≠±¨ א א פ ה ה ז ס ה ח י ם ה ∂Æ≥Æ≥≠±Æ א

    DNA Clean ש ב≠ מ ש ה א ל י י ה צ ל מ ÆDNA ה י ק י נ י ל ר ח ס ט מ י ר ק ז ע בה ק נ ק מ א ר ה ל ט ז י ÆZymo Research ק ר ב ל ח and Concentrator Kit שם ל ע ד ב י ח י ט ה י ק י ה ה ̈ ב א ז כ ר ע ל י י ס ם מ א ג ל א ה≠D̈NA א Æם י ל מ ד ש ב ל ∂ ב μ l≠ב DNA≠ל ה ה©elution® ש י צ ל ש א ע ר ל ש פ א מ ה

    Æף ס כ ן מ ה ז ב ר נ ה ך ל ס ח י ל י ש צ ג י ט ל ע א מ ל“ ל י צ ה”ה ז ט ה י ק ה

    ר... ח ז א א ג י נ ל ≈ ק

    ם י פ י ם ט א ג ר ק י ש י צ ך ר ̈ל א י ח ה ך ל י ר י צ י י ה ה ז פ ה י ט ה ̈ם מ צ ע בנ ק ל ם כ ל ז ש א ג י ל ך א ה י ל ש ה ה ל צ ל מ ה ̈ן ה ש א ט ר ב מ םÆ ב י ר ח אם י פ י ט ד ה ח ה א ̈ן ז י כ ל פ ף ע הÆ א נ ש י מ א ר ר נ ח ה א ר ב ח ש מ ד ם ח י ז נ אם ה ז ז מ א ג י ל ם ה ק א ד ב ם ל י ח ר נ ט י א ם מ י ט ע רÆ מ י ם ב י ב ש ח ה̈ם ל זÆא א ט פ ס ז א פ א ל ק נ ס ק ̈ז א א ל ק נ ד נ ן א ג ̈ם כ י ר ח ם א י מ י ז נ א בם ה י א ז ם ה ה ב ר ש מ ח רª ה י ם ב י ק י ז ם מ ה ם י ש ח ר ה מ ל א ם כ י מ ה י זם י נ ר צ י ן ה ק מ ז ר א ג י נ ל ק ד ל י מ ץ י ל מ י מ נ ך א כ י פ זÆ ל א ט פ ס פ בן ה ה ל ר א ב נ Æ ח י צ כ מ י ר א ק ם ב י ל י ע פ מ ̈ם ה ל ע ר ב י ם ב י ב ט ה

    Æ ר ח TaKaRa®א ה© ר ק ̈ס ט ט נ מ ר N̈EB פ Æך ל כ י ל נ י מ ם ל י נ ז ש א ג י ל ל ה ש נ ש ם ה ד י מ א ע ף ה ס ב נ ש ט ח ב י הם ה ה מ ז י ק א ד ב ̈ ל ז א ג י ל ל י ש מ ג ם ד י ק פ ה ס מ כ ש מ ק ב י ל א ד ד כ י מ

    Æ נ ל ל ה≠DNA ש ר ע י ה ב ב ט ה ה ר צ ל ב ע פ Æ®≤ר י ז©א ר ג ג‘ל א ה ב י צ ג י ל י ה י צ ק א י ץ א ר י ר ה א ל ל נ א ר ל א נ ע ל כפ ל ח מ̈ ה ל ע ר נ ד ח מ ה ר ט ק י ה ס ̈ז פ ר ג א ג‘ל ה א ב ר ן ל י נ י ש פ כ̈ן ם כ ̈ז א א ג י ל ר≥®Æ ה י ר©א ה י ב י ג ר ל ק ל ל מ ק ש ל מ ע ר ב צ בן י ן א י י ד ע ך ש ל כ ה̈ע ז ה ל ם ז י מ י א ר מ ד ח מ ה ר ט ק צ ה ̈ב ק ט י ל ה ע פ ז א ג י ם ל י ז נ א ם ה ע פ אÆ ה ב ן ה י ל י ג ח ב ח ש ם≠ נ י ט נ מ ר פ ס נ ר ל ט ב ש ש מ

    ■ Æם ש א א ל

    י ס י ס ר ב ק ח ט מ י ”ש ס ר ק ה ב צ ר א מ ה ק ס ‘ב צ ד ר נ ב ג ב “ר ד

    ל א ש צ ל ר ם ב. א י ב לא ט י ס ר ב י נ א י ב ר ל ק ל ה מ י ג ל י ב ב

    א נ , א י ר ל ק ל מ ה ה י ג ל י ב ם ה ח ב ם י ב ם ט י פ י ע ט י צ ה א ל ל א ש

    [email protected] :ל ב כ

    λ Bst Ell λ Hin dlll

    ם ז. א א ג י ל ל ה י ע ל פ ה ש ר י ה ה מ ק י ד ‡Æ± ¯ÂÈ ב

    י ר ר, ה י א א ב ר ן ל י נ י ש פ ב, כ ט י ל ה ע ז פ א ג י ל הט. ב י ש ן ה ל ש י כ י ל א ר ח ה א נ י ז א א ג י ל כ ה י א ש

    ז ר ג ל א ג‘ ה ב י צ ג י י ל י צ ק א י ל ר ה ש צ ר ‡Æ≤ ¯ÂÈ ה

    ד י מ ס ל 1. פה י צ ג י י ל י צ ק א י 2. ר

    ר ד ח 3. מλ Bst EII DNA ר ק ר 4. מ

    37 | 2010 ר ב ט ק ן5 א י ל י Bio ג Inform