Embed Size (px)
Citation preview
1
• Définition :
= La phylogénie est l'étude des relations de parentés entre différents êtres vivants en vue de comprendre l'évolution des organismes vivants
Reconstruction des relations évolutives et leur représentation dans des «arbres».
La phylogénie Page 17
2
• La vie a une histoire, elle a changé au cours du temps et différentes espèces partagent un ancêtre commun.
La phylogénie Page 17
3
• Un arbre est une hypothèse au sujet des relations entre organismes.
La phylogénie Page 18
3 domaines (= clades)
4
• Un arbre est une hypothèse au sujet des relations entre organismes.
La phylogénie Page 18
3 clades = domaines
Les archées forment un groupe de micro-organismes unicellulaires
5
• Un arbre est une hypothèse au sujet des relations entre organismes.
La phylogénie Page 18
3 clades = domaines
Les bactéries sont des organismes vivants unicellulaires
6
• Un arbre est une hypothèse au sujet des relations entre organismes.
La phylogénie
3 clades = domaines
Procaryotes
7
• Un arbre est une hypothèse au sujet des relations entre organismes.
La phylogénie Page 18
3 clades = domaines
Les eucaryotes
Animaux
8
Les Animaux Page 18
9
Les Vertébrés Page 19
10
• ≠ lecture d’un arbre généalogique
Comprendre la phylogénie Page 19
11
• Spéciation = branche
Comprendre la phylogénie Page 20
12
• Les phylogénies tracent des dessins d’ancêtres partagés entre les lignées
Comprendre la phylogénie Page 20
13
• Chaque lignée a des ancêtres qui sont uniques à cette lignée et des ancêtres qu’elle partage avec d’autres lignées, des ancêtres communs.
Comprendre la phylogénie Page 20
14
• Définition :
= Un clade est un groupe monophylétique d'organismes vivants ou éteints comprenant un organisme particulier (ancêtre commun) et l'entièreté de ses descendants.
Un clade Page 20
15
• Définition :
= Un clade est un groupe monophylétique d'organismes vivants ou ayant vécu comprenant un organisme particulier et l'entièreté de ses descendants.
Monophylétique
16
Un clade Page 20
17
• Imbriqués les uns dans les autres (hiérarchie)
• Un clade peut inclure plusieurs milliers d’espèces ou seulement quelques-unes.
Les clades Page 21
18
• Echelle ou branches
Phylogénie Page 21
19
• Echelle ou branches
Phylogénie
20
• Interprétation:
Phylogénie (lecture) Page 21
ROSEPINMOUSSES FOUGERES
Evénement de spéciation original
Lig
née
n°1
Lig
née
n°2
évol
uti
on
Nbres caractéristiques partagées
≠ ancêtres des autres plantes
≠ plantes primitives
21
Phylogénie (lecture)
• 3 éléments importants:
– Eléments n°1:
Page 21-22
22
Phylogénie (lecture)
• 3 éléments importants:
– Eléments n°2:
Page 21-22
23
Phylogénie (lecture)
• 3 éléments importants:
– Eléments n°3:
Page 21-22
ROSEPINMOUSSES FOUGERES ROSEPIN MOUSSESFOUGERES
24
Evolution humaine
• Phylogénie des espèces proches de nous:
Page 22
Gor
illes
Hum
ains
Chim
panz
és
Bono
bos
25
Construire les arbres
• Les arbres phylogénétiques représentent des généalogies.
– On recueille des caractères:
= Traits héritables qu’il est possible de comparer entre les organismes.
- caractères physiques (morphologique)
- séquences génétiques
- traits comportementaux
Page 22
26
Phylogénie des vertébrés Page 17
27
Phylogénie des vertébrés
• Procédure:
– Examiner des représentants de chaque lignée
→ infos sur leur morphologie
- Vertébrés ou non
- Squelette osseux ou non
- Quatre membres ou non
- Œuf amniotique
- …
Page 22-23
28
Phylogénie des vertébrés
• Procédure:
–Construction de l’arbre
→ plusieurs arbres, plusieurs hypothèses
Comment faire ?
Le principe de parcimonie
Page 22-23
29
Phylogénie des vertébrés
• Le principe de parcimonie
Choisir l’arbre le plus économique, le moins coûteux en hypothèses de transformation
- Il stipule que les innovations évolutives sont rares
→ hypothèse qui admet le moins d’innovations
Page 22-23
30
Construire les arbres
• Utiliser les caractères dérivés partagés
– Caractère dérivé = caractère qui a évolué dans une lignée → clade et qui s’épare ses membres d’autres individus
– Caractère partagé = caractère que 2 lignée ont en commun
Page 23
31
Construire les arbres
• Utiliser les caractères dérivés partagés
→ trouver des preuves
→ grouper des organismes dans des clades monophylétiques.
Page 23
32
Construire les arbres
• Utiliser les caractères dérivés partagés
– Exemple:
Page 23
Comment déterminer les relations à l’intérieur de ce clade ?
Examiner d’autres caractères qui varient dans les différentes lignées du clade
33
Homologie / homoplasie
• Caractères homologues
= caractères similaires chez plusieurs organismes qui révèlent un héritage d’un ancêtre commun qui avait aussi ce caractère.
Page 23
= indicateur fiable de l’existence d’un ancêtre commun
34
Homologie / homoplasie
• Caractères homologues
– Exemple:
Page 23
35
Homologie / homoplasie
• Membres antérieurs:
Page 23
En vert les os de la main
En rose l’humérus
En violet le radius et le cubitus
En jaune les clavicules et omoplates
36
Homologie / homoplasie
• Tous les caractères ne sont pas des homologies
• Exemple:
– Les oiseaux et les chauves-souris ont des ailes, alors que les souris et les crocodiles n’en ont pas
– Cela veut-il dire que les chauves-souris ont une parenté plus proche avec les oiseaux qu’avec les souris et les crocodiles?
NON
Page 24
37
Homologie / homoplasie
• Examinons les ailes des chauves-souris et des oiseaux
Page 24
Chauve-souris Oiseau
38
Homologie / homoplasie
• Représentation phylogéniques
Page 24
Chauve-souris
Evolution de quatre membres
Membres antérieurs ont évolué en ailes
OiseauSouris Crocodile
39
Homologie / homoplasie
• Représentation phylogéniques
Page 24
Chauve-souris
Evolution de quatre membres
Membres antérieurs ont évolué en ailes
OiseauSouris Crocodile
= origine évolutive différente, mais ressemblance.
= évolution convergente
Homoplasie de fonction = analogie
40
Caractère dérivé / ancestral
= Caractère qui a évolué dans une lignée → clade monophylétique et qui sépare ses membres d’autres individus
= une synapomorphie
• Exemple:
– Les plumes des oiseaux
Page 24-25
Une synapomorphie est une homologie
41
Caractère dérivé / ancestral
= Caractère qui n’a pas subi de modification au cours de l’évolution.
= une plésiomorphie
Ce caractère homologue a été conservé depuis le premier ancêtre du groupe le présentant, mais pas nécessairement présent dans toutes les espèces qui en descendent.
Exemple: la pentadactylie
→groupe paraphylétique
Page 24-25
42
Extra-groupe Page 26
