Upload
putrisarahariesta
View
307
Download
0
Embed Size (px)
DESCRIPTION
bio
Citation preview
Energi adalah: kemampuan dari suatu sistem untuk dapat melakukan kerja
Fungsi energi: membuat senyawa2 baru Menjalankan kerja mekanik pada pergerakan Melakukan transport senyawa Menghasilkan panas
Bioenergetika : bagian dari biokimia yang bersangkutan dengan transformasi dan penggunaan energi oleh sel hidup
sun Heat E
Radiant E
E lost toenvironment
PhotosynthesisTakes place in
Plant cell,yielding: human
O2
E stored inbiomolecules
Respiration take place in Human cells,yielding :
E for work
E stored inbiomolecules
CO2
H2O
Energy 2 form :1. Kinetic E : the E of motion ( a ball rolling
down a hill, heat warming a frying pan, parfume spreading through the air )
2. Potential E : is stored E ( in the position of the electrons that form the chemical bond )
E can be converted from one form to another. Thermodynamics is the study of E use.
Bioenegetics ( bios : life + en:in + ergon: work) the study of E flow through biological system.
E is transferred between molecules during reactions.A + B C + D
A & B : reactants / substratesC & D : products
The potential E stored in the chemical bonds of molecule is known as the free energy of the molecule.
I. Hukum pertama:didalam setiap perubahan fisik atau kimia, jumlah total energi pada sebuah sistem termasuk energi sekitarnya adalah konstan= Hukum kekekalan energi
II. Hukum kedua :semua perubahan fisik atau kimia cenderung berjalan menuju arah sdmkn rupa sehingga energi yang bermanfaat terurai secara tidak dapat balik (irreversibel) menjadi bentuk acak yang tidak teratur, yang disebut entropi. Penguraian terhenti pada titik keseimbanganJagat raya cenderung menuju ketidakteraturan
Entropi :- energi dalam keadaan acak atau tidak teratur
atau juga disebut energi yang tidak berguna- derajat ketidakteraturan atau keteracakan sistem
Energi yang bermanfaat :1. Energi bebas, yaitu jenis energi yang dapat melakukan
kerja pada suhu dan tekanan tetap2. Energi panas, yaitu jenis energi yang dapat melakukan
kerja hanya melalui suatu perubahan suhu/tekanan.
Bentuk energi yang dapat digunakan oleh sel adalah energi bebas(dapat bekerja pada suhu dan tekanan tetap)
Kelangsungan suatu proses dpt berlangsung secara spontan /tidak, tergantung pada perbedaan potensial keadaan awal dan akhir, apakah positif/negatif.
Dimana : (∆P =P2 – P1)1.EKSERGONIK : ∆P < 02.ENDERGONIK : ∆P > 03.KESEIMBANGAN : ∆P = 0
Dalam sistem biologi mengikuti hukum termodinamika ∆G = ∆E - T .∆Sjika ∆G (-) : eksergonik (katabolisme), proses berlangsung spontan dgn kehilangan energi bebasjika ∆G (+) : endergonikjika ∆G 0 : sistem berada dalam keseimbangan dan tidak ada perubahan netto yang terjadi
Eksergonik : reaksi berlangsung spontan dgn kehilangan energi bebasDisebut jg katabolisme : pemecahan/oksidasi molekul bahan
Endergonik : reaksi berlangsung hanya kalau diperoleh energi bebas.disebut juga anabolisme : reaksi sintesis yang membangun berbagai substansi
Katabolisme + anabolisme = metabolisme
Metode untuk merangkaikan proses eksergonik dgn endergonik:1. harus ada zat antara (I) , ex : A + C→ I → B + D2. mensintesis senyawa dgn potensial energi tinggi dalam reaksi eksergonik dan menyatukan senyawa baru ini kedalam reaksi endergonik → energi bebas dr lintasan eksergonik dialihkan ke lintasan endergonik.
Struktur polimer untuk proses katabolisme anabolisme
Tahap 1, 2, 3 dibedakan berdasarkan ukuran molekul
Proses endergonik berlangsung lewat perangkaian (coupling) dengan proses eksergonik.
ATPadalah rantai kimia utama di antara aktifitas sel penghasil energi dan aktifitas sel yang membutuhkan energi.
Yang termasuk reaksi endergonik adalah:1. Biosintesis makromolekul2. Kontraksi otot3. Eksitasi syaraf4. Transport aktif5. Termogenesis6. Pemindahan info genetik
ATP has special roles in energy coupling & Pi transfer. G of phosphate hydrolysis from ATP is intermediate among examples below. ATP can thus act as a Pi donor, & ATP can be synthesized by Pi transfer, e.g., from PEP.
Compound Go' of phosphate hydrolysis, kJ/mol
Phosphoenolpyruvate (PEP)
Carbamoil phosphat
Phosphocreatine
Pyrophosphate
ATP (to ADP)
ADP (to AMP)
Glukosa-1-phosphat
Glucose-6-phosphate
Glycerol-3-phosphate
Phosphoanhydride bonds (formed by splitting out H2O between 2 phosphoric acids or between carboxylic & phosphoric acids) have a large negative G of hydrolysis.
N
NN
N
NH 2
O
OHOH
HH
H
CH 2
H
OPOPOP-O
O
O- O-
O O
O-
adenine
ribose
ATP adenosine triphosphate
phosphoanhydride bonds (~)
N
NN
N
NH2
O
OHOH
HH
H
CH2
H
OPOPOP-O
O
O- O-
O O
O-
adenine
ribose
ATPadenosine triphosphate
phosphoanhydridebonds (~)
Phosphoanhydride linkages are said to be "high energy" bonds. Bond energy is not high, just G of hydrolysis. "High energy" bonds are represented by the "~" symbol.~P represents a phosphate group with a large negative G of hydrolysis.
Potentially, 2 ~P bonds can be cleaved, as 2 phosphates are released by hydrolysis from ATP.
AMP~P~P AMP~P + Pi (ATP ADP + Pi)
AMP~P AMP + Pi (ADP AMP + Pi)
Alternatively: AMP~P~P AMP + P~P (ATP AMP + PPi)
P~P 2 Pi (PPi 2Pi)
ATP dapat berfungsi sbg senyawa antara, karena : Energi bebas baku atau ∆G0,adl perbedaan antara energi
bebas peraksi dan energi bebas produk pd keadaan baku/standar
Cara menghitung perubahan energi bebas baku : ∆G0 = -2,303 R.T log K’eq,dimana ∆G0 = energi bebas baku R = tetapan gas(1,987 kal/mol. K) T = suhu mutlak(2890 K atau 250 C) K’eq = tetapan kesetimbangan
∆G0 (-) : produk mengandung energi bebas <pereaksi → reaksi berjalan kearah pembentukan produk pada keadaan baku
∆G0 (+): produk mengandung energi bebas >pereaksi → reaksi berjalan dr pembentukan produk ke arah pereaksi
1. Enzim kinase : mengkatalisis pemindahan senyawa fosfat dr senyawa fosfat berenergi super tinggi
2. Kinase khusus lainnya mengkatalisis pemindahan senyawa fosfat terminal dari ATP ke suatu molekul penerima
Pengaruh akhir dr ke2 reaksi tsb, yang dihubungkan oleh
senyawa antara ATP, adalah pindahnya energi kimia dari fosfat berenergi super tinggi menuju ke suatu molekul penerima melalui pemindahan gugus fosfat
ATP hampir selalu menjadi perantara bagi reaksi pemindahan gugus fosfat, krn : sel biasanya tidak mengandung kinase yang dapat memindahkan senyawa fosfat scr langsung dr senyawa fosfat berenergi super tinggi kpd senyawa penerima berenergi rendah
Terdapat 2 senyawa penting pemberi gugus fosfat kepada ADP, yaitu 3-fosfogliseril fosfat dan fosfoenolpiruvat. (keduanya di btk pd rx pemecahan glukosa laktat energi. Proses ini disbt glikolisis)
Fosfoenolpiruvat jg memberikn gugus fosfatnya ke ADP mell rx yg dikatalisis oleh piruvat kinase
ATP dpt memindahkan gugus fosfat kpd berbagai molekul
penerima utk menghslkan senyawa fosfat berenergi rendah.
Reaksi ini dikatalisis oleh kinase.Diantara kinase ini terdapat heksokinase yg mengkatalisa
pemindahan gugus fosfat dr ATP ke D-Glukosa.ATP + D-glukosa Mg2+ ADP + D-glukosa 6-Fosfat.
Lainnya adalah gliserol kinase yg mengkatalisa rx:ATP + gliserol Mg2+ ADP + Gliserol 3-Fosfat
glukosa 6-fosfat dan gliserol 3-fosfat mempunyai
kandungan energi > tinggi dr glukosa & gliserol
bebas atau yang belum terfosforilasi.
Salah satu senyawa fosfat berenergi tinggi yg memainkan peran unik dlm kerja otot & jar yg mudah terangsang (otot, otak, saraf)
Mpy Δ G0 hidrolisis sebesar -10,3 kkal/mol. Dpt memindahkan gugus fosfatnya kpd ATP dlm
suatu reaksi yang dikatalisis enzim kreatin kinase.
Senyaw seperti fosfokreatin & fosfoarginin (pd intervertebrata) yg berfungsi sbg cadangan energi tsb disebut FOSFAGEN.
Uridin trifosfat ( UTP ) Guanosin trifosfat ( GTP ) Sitidin trifosfat ( CTP ) 2’-deoksiadenosin 5’-trifosfat ( dATP ) 2’-deoksiguanosin 5’-trifosfat ( dGTP ) 2’-deoksisitidin 5’-trifosfat ( dCTP ) 2’-deoksitimidin 5’-trifosfat ( dTTP )
ATP + UDP ↔ ADP + UTP
Senyawa tsb terdpt di semua sel, ttp pd konsentrasi yg jauh > rendah dibandingkan dg ATP.
Senyawa tsb dikhususkan utk berfungsi pd lintas biosintetik tertentu.
Senyawa ini mdpt gugus fosfat terminalnya dr ATP dlm rx yg dikatalisis oleh enzim yg bergantung pd Mg2+ yg dinamakan nukleosida difosfokinase.
Nukleosida Trifosfat Produk biosintetik
UTP Polisakarida
CTP Lipid
GTP Protein
ATP, UTP, CTP, GTP RNA
dATP, dTTP, dCTP, dGTP DNA
Terdapat 3 struktur yang menentukan energi bebas baku hidrolisis ATP (penyebab utama bagi nilai ΔG۫ °′ hidrolisis ATP yang bersifat amat negatif) :1.Derajat ionisasi ATP dan produk hidrolisisnya .
Pd pH 7,0 ATP hampir sempurna meng-ion sbg ion ATP 4-
ATP4- + H2O ADP³¯ + HPO4²¯ + H+2.Pada pH 7,0 molekul ATP mpy 4 muatan negatif yang letaknya berdekatan yg saling tolak menolak dengan kuat.3.Masing2 dari kedua produk ADP 3- dan HPO4 2- merupakan hibrid resonansi. Hibrid resonansi adalah suatu bentuk stabil yg khusus, dg elektron ttt dlm konfigurasi yg mpy jauh > sedikit energi, dibandingkan dg kedudukan aslinya di dlm molekul ATP.
29
Pernahkan Kita membayangkannya?
kita menjadi sadar betapa kecilnya bumi dan kita para penghuninya.
Dalam skala ini bumi kita tidak kelihatan lagi !!!
Perhatikan betapa mungil ukuran matahari kita dibandingkan Arcturus !
Apakah Arcturus bintang terbesar di galaksi kita ?
Dalam skala ini, matahari kita hanya sebesar debu!
Antares adalah bintang ke 15 yang paling terang di angkasa. Jaraknya lebih dari 1000 tahun cahaya dari bumi.