4.3Metabolisme Asam Nukleat II

8/12/2019 4.3Metabolisme Asam Nukleat II

1/39

Metabolisme asam nukleat


2/39

Klp1. deteksi analisa DNA RNAKLP2 Mutasi GenKlP3 kelainan genKlp4 Kanker

Klp 5 ProteinKlp 6 Obat-obat yang bekerja pada DNA dan RNA


3/39

Merupakan proses metabolisme informasi, yangberbeda dgn metabolisme-metabolisme yang telahdipelajari sebelumnya: metabolisme intermediate

ensim berperanan dlm setiap reaksi yg terjadi.Proses perlekatan substrat dan menghasilkan

produkMetabolisme informasi ada cetakan yang perluditerjemahkan menjadi produk.

Cetakan DNA atau RNA, proses juga melibatkanberbagai enzim


4/39

Proses utama dlmmetabolisme informasi:

1. Replikasi DNA berperansbg cetakan untuksintesisnya sdr

2. Transkripsi Informasiyang ada pada DNAmenentukan RNA yangdiproduksi

3. Translasi RNA berperansbg cetakan untuk sintesissuatu rantai polipeptida ttt


5/39

Replikasi dan transkripsi hanya menggunakan 4nukleotidaTranslasi mengubah bahasa nukleotida ygterdiri dari 4 nukleotida menjadi bahasa proteinyang terdiri dari 20 huruf asam amino

Persamaan replikasi, transkripsi dan translasi membutuhkan cetakan proses terdiri dari inisiasi, elongasi dan

terminasi


6/39

ReplikasiSecara konsep sederhana

Proses mekanismenya komplek

Kesederhanaannya krnkonsep dr Watson & Crick

Transfer informasi melibatkan pembukaan doublehelix DNA yang diikuti secara bersamaan denganpembentukan dua pita baru pasangan dari pitaDNA yang lama


7/39

Replikasi dimulai pada suatu

lokasi tertentu arah dari replikasi tidaksemuanya sama

Sintesis DNA selalu denganarah 5 3

leading strand disintesis

secara kontinyu langging strand disintesis secara diskontinyu

okzaki fragment


8/39

Urutan nukleotida yang secara spesifik terikat padaprotein inisiasiMekanisme untuk mensintesi primer RNA dptdielongasi oleh DNA polimeraseInisiasi DNA replikasi pada E coli Ori C

Proses inisiasi replikasi DNA


9/39


10/39


11/39


12/39


13/39

Helicase membuka double helix DNAPrimase mensintesis primer RNATopoisomerase melepaskan torsi krn prosesmembukanya DNADNA polymerase dimer, melakukan elongasi baikpd lagging dan leading strandSliding clamp memegang rantai polipeptida barudengan cetakannya

Single strand DNA binding Protein SSBP menstabilkan cetakan DNA memfasilitasipengikatan nukleotida baru


14/39


15/39

DNA polimerasi I menghilangkan RNA primeryang melekat pada lagging strand DNA dan

mengganti dgn DNA,

DNA Ligase menyambung DNA antara okazakifragment satu dgn yg lain


16/39


17/39

DNA polimerase

Pada sel bakteri dikenalada 3 macam DNApolimerase

DNA polimerase I, IIdan IIIDNA polimerase I mempunyai aktivitaseksonuklease proofreading


18/39


19/39

Suatu proses untuk membaca informasi yang

disimpan dalam urutan nukleotida DNA RNARNA sintesis membutuhkan ensim RNA polimeraseMekanisme dibagi menjadi 3

Inisiasi

ElongasiTerminasi

Transkripsi DNA


20/39


21/39


22/39


23/39


24/39


25/39


26/39

Translation adalah proses membaca kodondan menggabungkan asam amino yang sesuaibersama-sama dengan ikatan peptida.Komponen proses translasi

Translasi DNA

1.mRNA consist of genetic code

2.Ribosome3. tRNA together with a.a

4.Enzymes


27/39

Translation process consists of 3 main stages

Initiation

Elongation

Termination

Initiation Activation of amino acids forincorporation intoproteins .


28/39

Activation of amino acids for

incorporation into proteins.


29/39

Codon urutan 3 nukleotida dalam mRNA yangmenspesifikasikan penggabungan suata asam amino ttt mjdprotein.

The relationship between codons and the aminoacids they code for is called the genetic code .

Genetic code 3 nucleotides - codon mengkode untuk 1 asam amino dlm suatuprotein


30/39

Not all codonsare used withequalfrequency.

There is aconsiderableamount ofvariation

in the patterns ofcodon usagebetween differentorganisms.


31/39

Relationships of DNA to mRNA to polypeptide chain.


32/39

Translation isaccomplished by theanticodon loop of tRNAforming base pairs withthe codon of mRNA inribosomes


33/39

Transfer RNA (tRNA)

composed of

a nucleic acid anda specific amino acid

provide the link betweenthe nucleic acid sequenceof mRNA and the aminoacid sequence it codesfor.

An anticodon asequence of 3 nucleotidesin a tRNA that iscomplementary to acodon of mRNA

Structure of tRNAs


34/39

Two initiation factors (IF1&IF3) bind to a 70S

ribosome.promote the dissociationof 70S ribosomes into free30S and 50S subunits.

mRNA and IF2, whichcarries- GTP- the charged tRNA

bind to a free 30S subunit. After these have all

bound, the 30S initiationcomplex is complete.


35/39

Only tRNA fMet is accepted to form theinitiation complex.

All further charged tRNAs require fullyassembled (i.e., 70S) ribosomes

The Shine-Dalgarno sequence helpribosomes and mRNA aligns correctly for

the start of translation.

Ribosome consists of- A site aminoacyl- P site peptidyl- E site exit


36/39

Peptide bondformation

catalyzed by anenzyme complexcalledpeptidyltransferase

Peptidyltransferaseconsists of someribosomal proteins andthe ribosomal RNA acts as a ribozyme .

The processis repeated until atermination signal isreached.


37/39

Termination oftranslation occurs whenone of the stop codons (UAA,UAG, or UGA) appears in the

A site of the ribosome.

No tRNAs correspond to thosesequences, so no tRNA

is bound during termination.

Proteins called release factorsparticipate in termination


38/39


39/39

Sampai jumpa danGood luck to

ur exam

Documents

4.3Metabolisme Asam Nukleat II