-
https://alevelbiology.co.uk
-
Structura primara - secventa aminoacizilor din lantul
polipeptidic
Secvență semnal
9-12 aminoacizi hidrofobi
N-terminal al lanțului
localizarea proteinei
-
Citocrom c (uman, 105
AA)MGDVEKGKKIFIMKCSQCHTVEKGGKHKTGPNLHGLFGRKTGQAPGYSYTA
ANKNKGIIW GEDTLMEYLENPKKYIPGTKMIFVGIKKKEERADLIAYLKKATNE
Structura primara
Metoda cu clorura de dansil
-
Determinarea structurii primare
Pehr Edman
1972-secventa
fibrinogenului
-
Structura primara - secventa aminoacizilor din lantul
polipeptidic
Frederick Sanger (Premiul Nobel 1958)
Secventa aminoacizilor in insulina (porc). Fiecare molecula
contine 2 lanturi polipeptidice
http://upload.wikimedia.org/
-
Structura primara – determinarea AA de la capatul C-terminal
https://www2.chemistry.msu.edu/
https://www.liverpool.ac.uk/
-
ProteineReactii
de
clivare
Etapa 1 Amestec
de
fragmenteSepararea
fragmentelor
Etapa 2 Fragmente
purificate
Etapa 3
secventarea
Secvente
individuale
Set de
secvente
individuale
Alinierea
secventelor
individuale
-clivarea
alternativa;
-separarea si
secventierea
Alinierea
secventelor
individuale
Secventa
completa
Determinarea structurii primare
-
Cunoasterea
structurii primare
Mw
Localizare AA
Identificarea de parti
functionale
Stabilirea relatii
de evolutie
-
Structura secundara
Modalitatile de impachetare ale lantului polipeptidic
legăturile peptidice
grupe peptidice planare
Golden,M., et al.,
Molecular Biology and Evolution,
34(8), 2016
unghiurile de torsiune
(diedrale sau de rotație)
C- N ()
C- C ()
Rotaţie constrânsă
H amidiciâ
R (C)
-
Structura secundara
Structura secundara descrie modalitatile de impachetare
ale lantului polipeptidic
Structura -Helix
L. Pauling in 1951
(Premiu Nobel)
3,6 aa / rotatie
Legături de hidrogen
www.brooklyn.cuny.edu
-
Linus Pauling
• singurul detinator a 2 premii Nobel
(1954-Chimie, 1962-Pace)
• A fost angajat al Institututului de
Stiinta si Medicina in Palo Alto,
California.
• prieten cu Albert Einstein.
• s-a dedicat chimiei cu scopul
de a ajuta umanitatea
• Profesorul a fost considerat
campionul vitaminei C.
-
Reprezentarea schematica
a helixului prin 3 modele:
A) Modelul cu bile si bete;
B) Modelul panglica;
C) Modelul cilindric
Momente de dipol
in helix
Structura -Helix
-
Diagrama Ramachandran pentru helixuri
Restrictiile conformaţionale
ale resturilor din proteină
Fiecare punct
Unghiurile φ şi θ
(fiecare rest din proteina)
ww2.chemistry.gatech.edu
Diagrama Ramachandran
hemoglobina
-
Structura -elicoidală
Feritina (o proteină - fixează fier) - 75%
24 x 4 elicoidale (A-D)
Helicobacter pylori (feritina)
Cho,K.J, et al.,
Journal Molecular Biology
390(1),83, 2016
3000-4500 Fe3+
chemistry.wustl.edu
-
Structura -pliata
1951 Pauling si Corey
Structura -pliata antiparalela Structura -pliata paralela
Structura -pliata mixta
-
2 - 22 de lanţuri polipeptidice
Structurile -pliate
medie / 6 lanţuri polipeptidice
1 lanţ polipeptidic < 15 AA
Structura antiparalelă > paralelă (stabilitate)
https://ib.bioninja.com.au/
-
Structura -pliata paralelaStructura -pliata antiparalela
Structura -pliata
Structura -pliata rasucita
A) Modelul cu bile si bete;
B) Modelul cu sageti;
C) Modelul cu sageti rotit cu 90
-
Structura -întoarsă (curbele )
Element de conexiune
Structura -întoarsă de tip II
https://ww2.chemistry.gatech.edu/
https://www.ebi.ac.uk/
buclele (suprafaţa proteinelor)
Recunoaștere
Papaleo, E. et al., Chem. Rev.
2016, 116, 11, 6391-6423
Interacțiuni proteina-proteina
-
Cheratina
Proteina stabila (punti disulfidice)
localizare
par
coarne
unghii
pene
Difractie cu raze X
2 lanturi polipeptidice
Structura superhelix (Cheratina din par)
H2O2
oxidare
Acid
tioglicolic
reducere
http://image.slidesharecdn.com/
-
Colagenul
Proteina frecventa la vertebrate
localizare
oase
dinti
tendoane
matrici fibroase
(piele)
continut
15-30% proline
3 lanturi -helix
Poli-L-prolina
http://www.soe.ucsc.edu/
-
Stanga - Fibre de colagen din
tendoanele aflate in gatul unei
pasari
Colagenul (2)
Dreapta-fibre de colagen din
coada unui soarece
-
Lanț polipeptidic
Gli-X-Y (X = Pro, Y = 4-HO-P, sau 5-HO-K)
Colagenul
https://www.tes.com/
