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1 Reconstrução filogenética: Inferência Bayesiana 1. Inferência filogenética baseada no princípio de verossimilhança 2. Inferência filogenética Bayesiana 3. Prática: MrBayes Objetivos: Compreender os princípios de inferência Bayesiana e a sua ênfase na probabilidade dos parâmetros e não na probabilidade da amostra como no caso clássico (verossimilhança).

1 Reconstrução filogenética: Inferência Bayesiana 1.Inferência filogenética baseada no princípio de verossimilhança 2.Inferência filogenética Bayesiana

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  • 1 Reconstruo filogentica: Inferncia Bayesiana 1.Inferncia filogentica baseada no princpio de verossimilhana 2.Inferncia filogentica Bayesiana 3.Prtica: MrBayes Objetivos: Compreender os princpios de inferncia Bayesiana e a sua nfase na probabilidade dos parmetros e no na probabilidade da amostra como no caso clssico (verossimilhana).
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  • 2 Inferncia filogentica por verossimilhana mxima Verossimilhana (L) Probabilidade (Amostra | Hipteses) Sequncias alinhadas rvores Comprimento dos ramos Modelos de substituio Inferncia filogentica Bayesiana 1. Verossimilhana mxima
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  • 3 Inferncia baseada no conceito de verossimilhana (L) Inferncia filogentica Bayesiana 1. Verossimilhana mxima
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  • 4 Sequncia 1 A A T C G A G C C A T A G C G Sequncia 2 A A C A G A C A C A G T C C G rvore com dois ns Inferncia filogentica Bayesiana 1. Verossimilhana mxima
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  • 5 Sequncia 1 A A T C G A G C C A T A G C G Sequncia 2 A A C A G A C A C A G T C C G Probabilidades de transio segundo o modelo de Jukes & Cantor Inferncia filogentica Bayesiana 1. Verossimilhana mxima
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  • 6 Qual a funo de verossimilhana, L(t), para todos os stios? Inferncia filogentica Bayesiana 1. Verossimilhana mxima
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  • 7 Qual o parmetro desconhecido na funo de verossimilhana? O parmetro desconhecido na funo de verossimilhana t Inferncia filogentica Bayesiana 1. Verossimilhana mxima
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  • 8 ln L = 1589,77447 e t = 0,03091825 Importante: Estima-se um nico valor para o parmetro. t nmero esperado de substituies por stio ln L Inferncia filogentica Bayesiana 1. Verossimilhana mxima
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  • 9 O parmetro desconhecido na funo de verossimilhana t Quem t? Produto da taxa de substituio pelo tempo Nmero total, por stio, de substituies em entre duas linhagens t = comprimento do ramo = 0,03091825 Inferncia filogentica Bayesiana 1. Verossimilhana mxima
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  • 10 Reconstruo filogentica: Inferncia Bayesiana 1.Inferncia filogentica baseada no princpio de verossimilhana 2.Inferncia filogentica Bayesiana 3.Prtica: MrBayes
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  • 11 Inferncia Bayesiana distribuio de probabilidade a posteriori constante de normalizao distribuio de probabilidade a priori funo de verossimilhana Inferncia filogentica Bayesiana 2. Inferncia Bayesiana
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  • 12 216 Inferncia filogentica Bayesiana 2. Inferncia Bayesiana
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  • 13 216 Inferncia filogentica Bayesiana 2. Inferncia Bayesiana
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  • 14 217 Inferncia filogentica Bayesiana 2. Inferncia Bayesiana
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  • 15 Inferncia filogentica Bayesiana 2. Inferncia Bayesiana
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  • 18 218 Inferncia filogentica Bayesiana 2. Inferncia Bayesiana
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  • 19 221 Inferncia filogentica Bayesiana 2. Inferncia Bayesiana
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  • 20 224 Inferncia filogentica Bayesiana 2. Inferncia Bayesiana
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  • 21 Reconstruo filogentica: Inferncia Bayesiana 1.Inferncia filogentica baseada no princpio de verossimilhana 2.Inferncia filogentica Bayesiana 3.Prtica: MrBayes
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